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SUMMARY:Soutenance de thèse de Florentin Allemand
DESCRIPTION:Florentin Allemand a le plaisir de vous convier à sa soutenance de thèse\, intitulée : Étude numérique de composés membranotrophiques : influence des antiagrégants plaquettaires sur la membrane plasmique des plaquettes. La soutenance se déroulera le mardi 3 décembre à 14h\, Amphi A\, UFR Sciences et Techniques (16 route de Gray\, à Besançon). Il est possible de suivre la soutenance en visioconférence (contact : florentin.allemand@edu.univ-fcomte.fr). \nRésumé :\nLa membrane des plaquettes joue un rôle majeur dans l’activation plaquettaire. Les plaquettes sont devenues les cibles privilégiées de médicaments comme les antiagrégants plaquettaires\, indiqués dans la prévention secondaire des maladies cardiovasculaires. Une cible de ces antiagrégants plaquettaire sont les récepteurs P2Y12 enchâssés dans la membrane plasmique des plaquettes. Par ailleurs\, les membranes lipidiques peuvent également accueillir des composés chimiques amphiphiles. Ces molécules sont appelées membranotropes en raison de leur forte propension à s’insérer dans les membranes lipidiques. Le caractère membranotrope d’antiagrégants plaquettaires antagoniste des récepteur P2Y12\, Ticagrelor et Prasugrel\, et leur implication sur la membrane plasmique ont été étudiés. Des modélisations de la membrane plasmique plaquettaire et des expériences in vitro ont permis de déterminer l’organisation et l’influence des antiagrégants plaquettaires sur la composition et les propriétés de celle-ci. L’effet des modifications des propriétés de la membrane dues aux antiagrégants plaquettaires sur les récepteurs P2Y12 enchâssés dans cette membrane a également été étudié.
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SUMMARY:Soutenance de thèse de Séverine Lallemand
DESCRIPTION:Séverine Lallemand a le plaisir de vous convier à sa soutenance de thèse\, intitulée : Caractérisation phylogénomique de la diversité génétique d’Échinococcus multilocularis : application à l’étude de patients français atteints d’échinococcose alvéolaire. La soutenance se déroulera le jeudi 12 décembre à 14h\, bâtiment Bio-Innovation (4 rue Charles Bried\, 25000 Besançon). \nComposition du jury :\nDr. Franck BOUÉ\, ANSES\, Malzéville – Rapporteur\nDr. Olivier REY\, IHPE\, Perpignan – Rapporteur\nPr. Matthieu LE BAILLY\, Chrono-environnement\, Besançon – Examinateur\nDr. Grégory KARADJIAN\, ANSES\, Maisons-Alfort – Examinateur\nDr. Aurélien MERCIER\, ÉpiMaCT\, Limoges – Examinateur\nPr. Jorge OYHENART\, CONICET\, La Pampa\, Argentina – Invité\nDr. Benoît VALOT\, Chrono-environnement\, Besançon – Directeur de Thèse \nRésumé :\nL’échinococcose alvéolaire (EA) est une maladie zoonotique grave reconnue comme maladie infectieuse émergente par l’OMS (Organisation Mondiale de la Santé). Elle est due à une infection par le métacestode d’Echinococcus multilocularis\, parasite intestinal dont les principaux hôtes définitifs sont le renard et le chien. Le parasite est présent uniquement dans l’hémisphère nord avec une aire de répartition allant du Canada à la Russie en passant par la Chine et le Japon. En France\, la maladie est historiquement associée à une zone endémique alpine (Doubs\, Jura\, Haute-Savoie) étendue par la suite au Grand-Est. Cependant\, depuis les années 1990\, de nouveaux cas apparaissent en dehors de cette zone. Cet élargissement est également observé en Europe\, tant en ce qui concerne la présence du parasite dans la faune sauvage que la maladie elle-même. Afin de mieux comprendre l’origine de ces souches\, une méthode précise de génotypage est nécessaire. Cependant\, les méthodes actuelles manquent soit de précision (séquençage de 2/3 gènes mitochondriaux) soit de reproductibilité (caractérisation d’un microsatellite multilocus nucléaire répété en tandem\, EmsB).\nDans ce contexte\, ce travail de thèse a consisté à développer une nouvelle méthode de génotypage en utilisant les techniques de séquençage haut-débit pour la reconstruction complète du génome mitochondrial d’E. multilocularis. Cette technique a été utilisée pour la caractérisation de 57 souches issues de prélèvements de patients français diagnostiqués entre 1987 et 2022. Ces données ont été confrontées à un panel de 56 souches d’origine humaine ou animale\, de tous les continents touchés par l’EA.\nL’analyse phylogénétique de ces données a permis de retrouver la structure cloisonnée entre les haplogroupes « européen »\, « asiatique » et « arctique »\, mais également un potentiel autre haplogroupe « mongol ». Chez les patients français\, trois sous-haplogroupes ont été mis en évidence. L’un de ces sous-haplogroupes rassemblait toutes les souches isolées chez les patients du nord-ouest de la France\, mais également des souches suisses\, suédoises\, polonaises et nord-américaines. La présence d’un unique haplotype dans le quart nord-ouest de la France semble témoigner d’une diffusion récente du parasite.\nDes études plus poussées (séquençage complet du génome nucléaire\, transcriptomique) de ce sous-haplogroupe pourraient permettre de mieux comprendre les raisons de son expansion récente. Par ailleurs\, cette nouvelle méthode de séquençage pourrait devenir le nouveau standard pour la caractérisation génotypique du parasite et offrirait de nouvelles perspectives quant à la compréhension de sa structure de population sur d’autres terrains d’étude (Chine\, Amérique du Nord…).
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SUMMARY:Soutenance de thèse d’Éline Dubois
DESCRIPTION:Éline Dubois a le plaisir de vous convier à sa soutenance de thèse\, intitulée : Impact des huiles essentielles sur l’antibiorésistance de Pseudomonas aeruginosa cultivé seul ou en co-culture. La soutenance se déroulera le mardi 17 décembre à 14h\, bâtiment Bio-Innovation (4 rue Charles Bried\, 25000 Besançon). Il est possible de suivre la soutenance en visioconférence (contact : eline.dubois@univ-fcomte.fr). \nComposition du jury :\nRapportrice : Dr Laetitia Daury\nRapportrice : Pr Karen Moreau\nExaminateur : Pr Jean-Marie Perrier-Cornet\nExaminateur : Dr Jean-Michel Brunel\nExaminateur : Pr Jean-Yves Maillard\nDirectrice de thèse : Pr Catherine Llanes\nInvité : Pr. Patrick Plésiat \nRésumé :\nPseudomonas aeruginosa est une bactérie opportuniste qui infecte de façon chronique les voies pulmonaires des patients atteints de mucoviscidose (CF). En raison de son antibiorésistance\, les patients CF se tournent de plus en plus souvent vers des thérapies alternatives telles que les huiles essentielles (HEs) sans que le bénéfice soit réellement évalué.\nDans ce travail\, nous avons identifié les mécanismes de résistance et de détection des composés extraits d’HEs chez P. aeruginosa mais avons aussi pu constater qu’ils pouvaient induire une résistance croisée avec les antibiotiques anti-Pseudomonas. En effet\, la souche de référence PA14 développe une résistante induite au cinnamaldéhyde (CNA\, extrait de l’HE de cannelle)\, notamment grâce à la mise en place de mécanismes de défense impliquant les pompes d’efflux actif\, dont MexAB-OprM. Cette voie de défense est mise en place grâce à plusieurs régulateurs\, en particulier le répresseur NalC\, mais aussi le système à deux composants AmgRS qui détecte le stress membranaire causé par le CNA. Nous montrons également que pour permettre à MexAB-OprM de fonctionner de façon optimisée\, la bactérie fait des économies de protons qui constituent sa source d’énergie. Pour cela\, elle réduit le fonctionnement de l’ATP-synthase\, ce qui rend la bactérie hypersensible aux aminosides.\nUne deuxième ligne de défense passe par les voies enzymatiques impliquées dans la métabolisation des composés des HEs. Ainsi\, le CNA est métabolisé en alcool cinnamique grâce à des aldéhyde/alcool déshydrogénases (dont PA2275)\, pour être finalement éliminé par les oxydoréductases PA1880-PA1881.\nLa transposition de ces travaux sur des collections longitudinales de souches CF a montré que la sensibilité aux composés extraits d’HE a tendance à augmenter au cours de la colonisation (alors qu’elle diminue pour les antibiotiques)\, et que la résistance croisée était plus importante chez les souches de primo-colonisation. De plus\, les composés extrait d’HEs perturbent l’équilibre des populations du microbiote pulmonaire\, en particulier S. aureus\, co-isolé avec P. aeruginosa chez 21% des patients du CHU de Besançon. La combinaison HE/antibiotique ne favorisant pas l’éradication ni de S. aureus\, ni de P. aeruginosa\, il est préférable de déconseiller l’utilisation de ces composés naturels lorsqu’ils sont utilisés en combinaison avec les antibiotiques.
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