Professeur des Universités
Université Bourgogne Franche-Comté - CNRS
UMR 6249 Chrono-environnement

Contact : Francois.Gillet chez univ-fcomte.fr
UFR Sciences et Techniques
Bâtiment Propédeutique, -114L
16, route de Gray
25030 Besançon Cedex

Téléphone : +33 (0)3 81 66 62 81

Thèmes de recherche

 Structure et fonctionnement des communautés végétales
 Ecologie des communautés, écologie numérique
 Théorie des hiérarchies et modélisation dynamique des systèmes écologiques
 Gestion adaptative des systèmes socio-écologiques

Projets de recherche actuels et récents

 PubPrivLands : Public vs private lands’ interactions : economic, social and environmental causes of different uses and management options (responsable de Task).
 DynaGraR : Biodiversité et résilience des écosystèmes prairiaux dans le contexte de l’intensification écologique et des changements climatiques (doctorat de Corentin Nicod, directeur de thèse)
 IFEP : Impact de la fertilisation des prairies sur leur biodiversité et sur les transferts de bactéries du sol au lait (responsable de WP)
 DynaGraM : Modélisation de la dynamique des communautés herbacées des écosystèmes prairiaux (doctorat de Thibault Moulin, directeur de thèse)
 BioGEcoP : Biodiversité et gestion des écosystèmes prairiaux en Franche-Comté (doctorat de Leslie Mauchamp, directeur de thèse)
 ArcheoBioGeo – Projet International de Coopération Scientifique - PICS franco-suisse (CNRS – Institut National de l’Environnement et de l’Ecologie) : Interactions entre les activités humaines et les biogéosystèmes (responsable de projet).

Expérience de recherche

 Biodiversité végétale et animale des prairies permanentes en lien avec l’évolution des pratiques agricoles ; recherche du déterminisme de la diversité taxonomique, phylogénétique et fonctionnelle à différentes échelles (UFC)
 Etudes observationnelles et expérimentales des interactions biotiques dans les écosystèmes sylvo-pastoraux ; modélisation spatialement explicite de la dynamique des systèmes et paysages sylvo-pastoraux ; écologie des communautés microbiennes (Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne).
 Diversité et dynamique de la végétation des pâturages boisés jurassiens, études observationnelles et modélisation de la dynamique des phytocénoses ; mise en place du protocole de suivi de la végétation des zones alluviales (Université de Neuchâtel, Suisse).
 Inventaire botanique et phytosociologique des tourbières du Doubs, premières hypothèses sur leur régénération et leur génèse ; thèse de doctorat en phytosociologie forestière, premiers développements de la phytosociologie synusiale intégrée (Université de Franche-Comté).

Parcours académique

 Septembre 2008 à aujourd’hui : Professeur des Universités, Université de Franche-Comté, Besançon (France). UFR Sciences et Techniques, Laboratoire Chrono-environnement, UMR 6249 CNRS.
 Septembre 2008 à décembre 2018 : Professeur invité, École Polytechnique Fédérale de Lausanne EPFL (Suisse). Laboratoire des systèmes écologiques ECOS (Institut d’Ingénierie de l’Environnement IIE, Faculté de l’Environnement Naturel, Architectural et Construit ENAC).
 Avril 2004 à août 2008 : Collaborateur scientifique et chargé de cours, École Polytechnique Fédérale de Lausanne EPFL (Suisse). Laboratoire des systèmes écologiques ECOS (Institut des Sciences et Technologies de l’Environnement ISTE, Faculté de l’Environnement Naturel, Architectural et Construit ENAC).
 Octobre 2003 à août 2008 : Chargé d’enseignement, Université de Neuchâtel, Faculté des Sciences (Suisse). Laboratoire Sol & Végétation (Institut de Botanique).
 Avril 2001 à août 2008 : Chercheur senior, Université de Neuchâtel et École Polytechnique Fédérale de Lausanne EPFL (Suisse). Pôle de Recherche National Plant Survival, groupe de recherche Statistical and dynamical modelling. (dir. Prof. A. Davison, Chaire de Statistique EPFL).
 Avril 2001 à mars 2005 : Collaborateur scientifique, Institut de recherche fédéral WSL – Antenne Romande (Suisse). Projet du Fonds National Suisse de la Recherche Scientifique CATGRASS.
 Octobre 1995 à septembre 2003 : Maître-assistant et collaborateur scientifique, Université de Neuchâtel (Suisse). Laboratoire d’écologie végétale (Institut de Botanique).
 Janvier 1990 à septembre 1995 : Chercheur post-doctorant et coordinateur scientifique, Université de Neuchâtel (Suisse). Laboratoire d’écologie végétale (Institut de Botanique).

Publications

ResearcherID : B-6160-2008 (h-index 21)
Google Scholar (h-index 33)

Livres et chapitres d’ouvrages collectifs

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Borcard D., Gillet F. & Legendre P. 2014. Numerical Ecology with R - Chinese Edition. Higher Education Press, Beijing. ISBN-10 : 7040394723, ISBN-13 : 978-7040394726, 275 p.

Mauchamp L., Gillet F., Mouly A. & Badot P.M. 2013. Les prairies : biodiversité et services écosystémiques. Conseil National des Appellations d’Origine Laitières – Presses universitaires de Franche-Comté, coll. Pratiques et Techniques, Besançon, ISBN : 978-2-84867-437-7, 134 p. URL

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Borcard D., Gillet F. & Legendre P. 2011. Numerical Ecology with R. Springer, Use R ! series, New York, ISBN : 978-1-4419-7975-9, 302 p. URL

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Gillet F. 2001. L’étagement de la végétation. In : Ferrez Y. & Prost J.F. (ed.), Atlas des plantes rares ou protégées de Franche-Comté. Naturalia Publications, Turriers, p. 44-46.

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Articles dans revues internationales référencées ISI

Articles récents (2008-2018)

Jiménez-Alfaro B., Suárez-Seoane S., Chytrý M., Hennekens S., Willner W., Hájek M., Agrillo E., Álvarez-Martínez J.M., Bergamini A., Brisse H., Brunet J., Casella L., Dítě D., Font X., Gillet F., Hájková P., Jansen F., Jandt U., Kącki Z., Lenoir J., Rodwell J.S., Schaminée J.H.J., Sekulova L., Šibík J., Škvorc Ž. & Tsiripidis I. 2018. Modeling the distribution and compositional variation of plant communities at continental scale. Diversity and Distributions 24, 7 : 978-990. DOI:10.1111/ddi.12736

Dengler J., Wagner V., Dembicz I., Garcia-Mijangos I., Naqinezhad A., Boch S., Chiarucci A., Conradi T., Filibeck G., Guarino R., Janišová M., Steinbauer M.J., Aćić S., Acosta A.T.R., Akasaka M., Allers M.-A., Apostolova I. , Axmanová I., Bakan B., Baranova A., Bardy-Durchhalter M., Bartha S., Baumann E., Becker T., Becker U., Belonovskaya E., Bengtsson K., Benito Alonso J.L., Berastegi A., Bergamini A., Bonini I., Bruun H.H., Budzhak V., Bueno A., Campos J.A., Cancellieri L., Carboni M., Chocarro C., Conti L., Czarniecka-Wiera M., De Frenne P., Deák B., Didukh Y.P., Diekmann M., Dolnik C., Dupré C., Ecker K., Ermakov N., Erschbamer B., Escudero A., Etayo J., Fajmonová Z., Felde V.A., Fernández Calzado M.R., Finckh M., Fotiadis G., Fracchiolla M., Ganeva A., García-Magro D., Gavilán R.G., Germany M., Giladi I., Gillet F., Giusso del Galdo G.P., González J.M., Grytnes J.-A., Hájek M., Hájková P., Helm A., Herrera M., Hettenbergerová E., Hobohm C., Hüllbusch E.M., Ingerpuu N., Jandt U., Jeltsch F., Jensen K., Jentsch A., Jeschke M., Jiménez-Alfaro B., Kacki Z., Kakinuma K., Kapfer J., Kavgacı A., Kelemen A., Kiehl K., Koyama A., Koyanagi T.F., Kozub Ł., Kuzemko A., Kyrkjeeide M.O., Landi S., Langer N., Lastrucci L., Lazzaro L., Lelli C., Lepš J., Löbel S., Luzuriaga A.L., Maccherini S., Magnes M., Malicki M., Marcenò C., Mardari C., Mauchamp L., May F., Michelsen O., Molero Mesa J., Molnár Z., Moysiyenko I.Y., Nakaga Y.K., Natcheva R., Noroozi J., Pakeman R.J., Palpurina S., Pärtel M., Pätsch R., Pauli H., Pedashenko H., Peet R.K., Pielech R., Pipenbaher N., Pirini C., Plesková Z., Polyakova M.A., Prentice H.C., Reinecke J., Reitalu T., Rodríguez-Rojo M.P., Roleček J., Ronkin V. , Rosati L., Rosén E., Ruprecht E., Rusina S., Sabovljević M., Sánchez A.M., Savchenko G., Schuhmacher O., Škornik S., Sperandii M.G., Staniaszek-Kik M., Stevanović-Dajić Z., Stock M., Suchrow S., Sutcliffe L.M.E., Swacha G., Sykes M., Szabó A., Talebi A., Tănase C., Terzi M., Tölgyesi C., Torca M., Török P., Tóthmérész B., Tsarevskaya N., Tsiripidis I., Tzonev R., Ushimaru A., Valkó O., van der Maarel E., Vanneste T., Vashenyak I., Vassilev K., Viciani D., Villar L., Virtanen R., Vitasović Kosić I., Wang Y., Weiser F., Went J., Wesche K., White H., Winkler M., Zaniewski P.T., Zhang H., Ziv Y., Znamenskiy S. & Biurrun I. 2018. GrassPlot : a database of multi-scale plant diversity in Palaearctic grasslands. Phytocoenologia, 48, 3 : 331-347. DOI:10.1127/phyto/2018/0267

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Bourioug M., Girardclos O., Gillet F., Alaoui-Sehmer L., Bourgeade P., Alaoui-Sossé B. & Aleya L. 2018. Sewage sludge as a soil amendment in a Larix decidua plantation : Effects on tree growth and floristic diversity. Science of the Total Environment, 621 : 291-301. DOI:10.1016/j.scitotenv.2017.11.283

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De Cáceres M., Chytry M., Agrillo E., Attorre F., Botta-Dukát Z., Capelo J., Czúcz B., Dengler J., Ewald J., Faber-Langendoen D., Feoli E., Franklin S., Gavilán R., Gillet F., Gillison A., Jansen F., Jiménez-Alfaro B., Krestov P., Landucci F., Lengyel A., Loidi J., Mucina L., Peet R., Roberts D., Roleček J., Schaminée J., Schmidtlein S., Theurillat J.P., Tichý L., Walker D., Wildi O., Willner W. & Wiser S. 2015. A comparative framework for broad-scale plot-based vegetation classification. Applied Vegetation Science, 18, 4 : 543-560. DOI:10.1111/avsc.12179

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Rocchi S., Reboux G., Frossard V., Scherer E., Valot B., Laboissière A., Vacheyrou M., Gillet F., Roussel S., Raherison C. & Millon L. and the ELFE team. 2015. Microbiological characterization of 3193 French dwellings of ELFE cohort children. Science of the Total Environment, 505 : 1026-1035. DOI:10.1016/j.scitotenv.2014.10.086

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Jiménez-Alfaro B., Hájek M., Ejrnaes R., Rodwell J., Pawlikowski P., Weeda E., Laitinen J., Moen A., Bergamini A., Aunina L., Sekulová L., Tahvaninen T., Gillet F., Jandt U., Dítě D., Hájková P., Corriol G., Kondelin H. & Díaz T.E. 2014. Biogeographic patterns of base-rich fen vegetation across Europe. Applied Vegetation Science, 17, 2 : 367-380. DOI:10.1111/avsc.12065. Virtual Special Feature “Towards a consistent classification of European grasslands” (Eds. Dengler J., Bergmeier E., Willner W. & Chytrý M.).

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Chételat J., Kalbermatten M., Lannas K.S.M., Spiegelberger T., Wettstein J.B., Gillet F., Peringer A. & Buttler A. 2013. A contextual analysis of land-use and vegetation changes in two wooded pastures in the Swiss Jura Mountains. Ecology and Society, 18, 1 : 39. DOI:10.5751/ES-05287-180139

Gavazov K.S., Peringer A., Buttler A., Gillet F. & Spiegelberger T. 2013. Dynamics of forage production in pasture-woodlands of the Swiss Jura Mountains under projected climate change scenarios. Ecology and Society, 18, 1 : 38. DOI:10.5751/ES-04974-180138

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Seidl R., Fernandes P.M., Fonseca T.F., Gillet F., Jönsson A.M., Merganicova K., Netherer S., Arpaci A., Bontemps J.D., Bugmann H., Gonzalez-Olabarria J.R., Lasch P., Meredieu C., Moreira F., Schelhaas M.J. & Mohren F. 2011. Modelling natural disturbances in forest ecosystems : A review. Ecological Modelling, 222 : 903-924. DOI:10.1016/j.ecolmodel.2010.09.040

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