Mes recherches portent sur l’écologie de la faune sauvage et la santé des écosystèmes [1]. Elles visent à comprendre en quoi et à quelles échelles la structure spatiale des systèmes écologiques détermine la dynamique des populations de petits mammifères, de leurs prédateurs, de leurs pathogènes et des substances toxiques, et leurs impacts sur les socio-écosystèmes. Je m’intéresse aussi aux relations entre écologie et santé et aux conflits entre humanité et faune sauvage : rhinopithèques et éléphants d’Asie en Chine.
Elles explorent les conséquences des changements d’usage des terres : pratiques agricoles et pastorales, déforestation, reforestation, etc.. Elles s’insèrent dans le cadre conceptuel de l’écologie du paysage et de l’analyse multi-échelles des perturbations anthropogènes des écosystèmes régionaux, avec des implications en agriculture, santé et conservation.
Mes questions se situent à l’interface de plusieurs disciplines : écologie et sciences de la santé, écologie et sciences agronomiques, écologie et écotoxicologie, écologie et biologie de la conservation, etc.. Elles sont principalement fondées sur des études de terrain et mobilisent des réseaux de professionnels de l’agriculture, de la conservation et de la santé. Elles intègrent de manière systémique les méthodes de l’éco-épidémiologie et de l’écologie des populations pour comprendre, dans un cadre spatialement explicite, les interactions entre populations animales, les conflits entre humains et faune sauvage, et les mécanismes de transmission/transfert d’organismes pathogènes/substances toxiques in situ à différentes échelles spatiales et temporelles. Elles mettent l’accent sur le suivi à long terme à échelle régionale (> 10000 km2). Elles s’appuient sur la modélisation statistique, spatiale, la télédétection, les systèmes d’information géographique, et les méthodes de génétique moléculaire.
Mes terrains d’étude sont situés dans les montagnes d’Europe (Jura, Alpes), d’Asie centrale (plateaux du loess dans le sud du Ningxia et du Gansu, plateau tibétain, Tian Shan, Pamir, etc.), du sud-ouest de la Chine (Trois fleuves parallèles, Yunnan). J’ai été également impliqué dans des travaux collaboratifs sur les hauts-plateaux du nord du Mexique, en Indonésie (Sumatra, Bali) et en Afrique.
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Positions :
Maître de conférences à l’Université de Bourgogne de 1992 à 1998, professeur certifié de Sciences de la vie et de la terre en France (1980-1991) et au Niger (1977-1979).
Engagements (sélection) :
Fondateur et coordinateur du Groupement de recherche international CNRS-INEE "Ecosystem health and environmental disease ecology" 2013-2020 ; Co-fondateur et directeur de la Zone atelier Arc jurassien 2013-2016 ; Co-fondateur et directeur-adjoint de l’unité de recherche Chrono-environment (UMR UFC/CNRS 6249) 2008-2011 ; Directeur de l’unité de recherche "Biologie environnementale" EA3184 usc INRA 2004-2007 ; Directeur-adjoint 2000-2003 ; Cofondateur et directeur du Master "Écosystèmes, contaminants, santé" (ECoS) 2008-2014 ; cofondateur et directeur (2004-2008) du Master "Vie, terre, environnement, santé, société", cofondateur et directeur-adjoint (2000-2004) du Master "Environnement, santé et société - ESS" ; Membre fondateur et du comité de pilotage du Master d’Écologie des maladies infectieuses et évaluation du risque (ECOM-ALGER) de l’université de Kinshasa depuis 2014.
Comité de rédaction d’Alauda, Bourgogne Franche-Comté Nature, Parasite, Scientific Reports.
Pour une liste complète, accèdez à researchID/WoS ou ResearchGate
Je suis signataire de l’article #ScientistsWarningtoHumanity https://doi.org/10.1093/biosci/bix125 & https://doi.org/10.1093/biosci/biz088
Tribunes et articles de presse
Articles
2023
Lefrançois T, Lina B, COVARS, Autran B 2023. One Health approach at the heart of the French Committee for Monitoring and Anticipating Health Risks. Nature Communications. 14 Available here
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Giraudoux P, Boussarie D 2023. Vivre avec la faune sauvage : pour une prise en compte rénovée de la notion de « populations animales ou individus susceptibles d’occasionner des dommages (PAISOD) ». Bulletin de l’Académie Vétérinaire de France. https://doi.org/10.3406/bavf.2023.71046
Marston CG, Raoul F, Rowland C, Quéré JP, Feng XH, Lin RY, Giraudoux P 2023 Mapping small mammal optimal habitats using satellite-derived proxy variables and species distribution model. PLoS One. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0289209
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Michelat, D., Dupuis, O., Vaniscotte, A., Giraudoux, P., 2023. Quarante ans d’évolution du peuplement d’oiseaux nicheurs dans le bassin du Drugeon, Franche-Comté, France. Alauda, 91 (2):1-80.
Gauthier-Manuel, H., Bernard, N., Boilleaut, M., Giraudoux, P., Pujol, S., Mauny, F., 2023. Spatialized temporal dynamics of daily ozone concentrations : Identification of the main spatial differences. Environment International 173, 107859. Available here
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Bertrand A, Giraudoux P. Mace A (Edts) 2023. Les temps des pandémies. Belin. 230 p Available here
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Brun A, Greusard M, Reynes JM, Grenier M, Boumalid J, Giraudoux P. Chirouze C, Bouiller K, Bailly B. 2023 Health consequences of an outbreak of hemorrhagic fever with renal syndrome epidemic in the southern Jura Mountains in 2021. Infectious Diseases Now. Available here
2022
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Giraudoux P. 2022. La santé des écosystèmes : quelle définition ?. Bulletin de l’académie vétérinaire de France. eprint. 1-10 Available here
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Giraudoux, P., 2022. Pics épidémiques de fièvre hémoragique à syndrome rénal et stabilité historique des foyers : les connaissances écologiques sont encore insuffisantes pour les comprendre. Bourgogne Franche-Comté Nature 34, 131–142. Available here
Giraudoux P (edt). 2022. Socioecosystems. Indiscipline as a requirement of the field. ISTE, Londres. Available here
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2021
Afonso E, Fu R, Dupaix A, Goydadin AC, Yu ZH, Callou C, Villette P, Giraudoux P, Li L 2021 Feeding sites promoting wildlife-related tourism might highly expose the endangered Yunnan snub-nosed monkey (Rhinopithecus bieti) to parasite transmission. Scientific Reports 11, 15817 Available here
Umhang G, Demerson JM, Legras L, Boucher JM, Peytavin de Garam C, Bastid V, Vannard E, Pinot A , Giraudoux P, Boué F. 2021. Rodent control programs can integrate Echinococcus multilocularis surveillance by facilitating parasite genotyping : the case of Arvicola terrestris voles screening in France. Veterinary Parasitology, Available here
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Guo BP, Zhang ZZ, Guo YZ, Guo G, Wang HY, Ma5 JJ, Chen RG, Zheng XT, Bao JL, He L, Wang T, Qi WJ, Tian MX, Wang JW, Zhou CL, Giraudoux P, Marston CG, McManus DP, Zhang WB, Li J 2021 High endemicity of alveolar echinococcosis in Yili Prefecture, Xinjiang Autonomous Region, the People’s Republic of China : infection status in different ethnic communities and in small mammals. PLOS NTD Available here.
Afonso E, Fu R, Dupaix A, Goydadin AC, Yu ZH, Li DY, Giraudoux P, Li L 2021 Creating small food-habituated groups might alter genetic diversity in the endangered Yunnan snub-nosed monkey. Global ecology and conservation. Available here.
2020
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2019
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Fernandez-de-Simon J, Coeurdassier M, Couval G, Fourel I, Giraudoux P 2019 Do bromadiolone treatments to control grassland water voles (Arvicola scherman) affect small mustelid abundance ? Pest Management Science. 75 (4) : 900-907. Available here.
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Giraudoux P, Raoul F, Quéré JP, & Rieffel D 2023 MicromAsia : small mammal surveys in Western China and Kyrgyzstan (1994-2014) (1.0.0) [Data set]. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.7614879
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Delattre P, Giraudoux P, Quéré JP, & Damange JP 2022. Population dynamics of small mammals in the Jura massif, Franche-Comté, France (1979-2000) (1.0.0) [Data set]. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.6997317
Souvairan P, Giraudoux P, Michelat D. 2022. Bird counts at Buanyuantula, Makalondi, Niger 1991-1993 (1.0.0) [Data set]. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.6905506
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Giraudoux P, Raoul F, Quéré J.P., Rieffel, D. 2022. Small mammal survey in Narati (China) and Sary-Mogul (Kyrgyzstan) (1.0) [Data set]. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.6379911
Michelat D, Giraudoux P. 2022. Distribution of waterbirds along the Drugeon river, France [Data set]. In Nos Oiseaux (1.0.0, Vol. 69, Number 2, pp. 111–136). Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.4540002
Giraudoux, P., Couval, G., 2020. Numerical response of predators to large variations of grassland vole abundance and long-term community change. [Data set] Dryad. https://doi.org/10.5061/DRYAD.QZ612JMD3
See also : dat@ubfc
Un certain nombre de gestionnaires de bibliographie, dont Zotero, sont basés sur des fichiers de style de citation spécifiques de chaque format de journal (Citation style language, CSL). Les auteurs intéressés à publier dans Bourgogne Franche-Comté Nature peuvent procéder de deux manières :
Plus d’une cinquantaine d’autres gestionnaires utilisent le même format *.csl. Voir la liste ici : https://citationstyles.org
Importer ses POI ou waypoints dans un système de navigation sur smartphone : Les dénombrements sur route (ex. comptages nocturnes au phare, etc.) sont souvent effectués le long de segments de route dont les sommets sont géoréférencés, mais pour naviguer de la fin d’un segment au début de l’autre, il faut naviguer sur la route. Certains GPS peuvent facilement importer des waypoints mais ne permettent pas la navigation sur route, et ceux qui autorisent la navigation ne permettent généralement pas l’importation de waypoints (Waze, Mappy, ViaMichelin, etc.), excepté quelques sharewares. Vous trouverez dans le pdf ci-dessous une solution de contournement basée sur la combinaison de deux logiciels Google [2], My Maps et Maps, sur un smartphone.
Caractère chinois dans QGIS et import/export de fichiers Excel ou txt avec des caractères chinois dans R
Comprendre sans formule ce qu’est un modèle à effet mixte. Ici il est expliqué par un exemple et sans formule, ce qu’est la notion d’effet aléatoire (random effect) et quelle est sa place dans un modèle linéaire à effet mixte (= modèle hierarchique = modèle multiniveau).
[1] Ecohealth est un domaine de la science "engagé à promouvoir la santé humaine, animale et des écosystèmes, et à mener des recherches qui reconnaissent les liens inextricables entre la santé de toutes les espèces et leurs environnements. Un principe de base est que la santé et le bien-être ne peuvent être maintenus sur une planète aux ressources appauvries, polluée et socialement instable. C’est la raison pour laquelle les chercheurs en Ecohealth et les praticiens mettent en œuvre des approches systémiques et intégrées pour optimiser de façon durable les services écosystémiques liés au concept de santé (humaine, animale, des écosystèmes) et la stabilité sociale. Elles favorisent et promeuvent l’interdépendance, la coexistence et l’évolution des êtres vivants et leur environnement".
[2] J’aurais préféré fournir une solution avec un système qui ne soit pas basé sur le trafic d’informations personnelles, mais je n’en ai pas encore trouvé un pertinent. Les précautions habituelles concernant l’utilisation des informations personnelles par GAFAM et entreprises similaires doivent être considérées.