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Recherche > Plateforme technologique d’étude des Environnements Anciens et Actuels (PEA²t) > Biologie, Biologie Moléculaire, Ecophysiologie (B2ME)

Microbiologie environnementale - cytométrie (Montbéliard)

Pôle B2ME

Responsable :
TOUSSAINT Marie-Laure
Bureau : 4 - Tél : +33 3 81 99 46 90
Mail : TOUSSAINT Marie-Laure

Localisation
Montbéliard - Bâtiment Recherche - étages 1 et 2

Résumé bref de l’activité
Caractérisation et comptage des populations de micro-organismes, isolement et culture de micro-organismes, caractérisation génétique.

Les analyses ou préparations

  • Isolement et comptage de populations fongiques et bactériennes de sol ou végétaux.
  • Mesure de la colonisation mycorhizienne des plantes.
  • Préparation d’échantillon pour caractérisation génétique (extraction, amplification, migration et quantification d’ADN / ARN).
  • Etude des cinétiques de croissance microbiennes en conditions de température et d’humidité contrôlées.
  • Culture en bioréacteur.
  • Culture végétale en chambre de croissance sous conditions de température et d’hygrométrie contrôlées, test de germination et de croissance.
  • Mesure des biomasses bactériennes et algales d’échantillons en solution par cytomètrie (quantification et qualification de cellules en fonction de leur taille, leur granulosité et de leur fluorescence).

Liste des appareillages

  • biologie moléculaire : vibro broyeur à bille, centrifugeuse, thermocycleur, électrophorèse sur gel, spectrophotomètre ADN
  • lecteur de microplaque TECAN Spark équipé pour : mesures d’absorbance UV-visible (200 à 1000nm), gestion de l’humidité, quantification de l’ADN/ARN microbien sur plaque Nanoquant
  • autoclave vase clos 90L, autoclave de paillasse (CertoClav EL 18L), hotte à flux laminaire
  • incubateur- agitateurs pour plaque 96 puits ou pour flacons
  • bioréacteur /fermenteur contrôlé avec 2 cuves en verre (2 et 5 L)
  • 1 salle de culture au sol avec 8 projecteur VEGELED (spectre rouge et blanc) et 4 profilés LED sur paillasse
  • BD Accuri C6 Flow Cytometer (passeur plaque et tube, excitation 488 et 640 nm, détection à 530, 580, 670 et 675 nm)
  • 2 stéréo microscopes LEICA.

Contact :
TOUSSAINT Marie-Laure

publié le , mis à jour le