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LE BAILLY Matthieu

Paléoparasitologie

Maître de conférences UBFC

Contact : matthieu.lebailly chez univ-fcomte.fr

Tél : +33 (0)3 81 66 57 25

Université de Bourgogne Franche-Comté
UFR Sciences et Techniques
UMR 6249 Chrono-environnement

16, Route de Gray
25 030 Besançon cedex

FRANCE

Visiter notre site internet : https://paleoparasitologie.univ-fcomte.fr/

 

Thématique de recherche

Développer la mise en évidence et l’étude des formes de résistance des parasites intestinaux (helminthes et protozoaires) dans les sols anciens par des méthodes de coprologie, d’immunologie et de biologie moléculaire.
Cette discipline, appelée paléoparasitologie, permet d’étudier l’histoire et l’évolution des maladies parasitaires au cours du temps : apparition, disparition et migration. Elle s’attache à appréhender la biodiversité parasitaire dans les différentes périodes préhistoriques et historiques, ainsi que l’importance relative des parasites à chaque époque. Elle a également pour vocation d’étudier l’évolution de la relation hôte/parasite, les modifications des cycles biologiques parasitaires et les transferts inter-hôtes, depuis les premiers contacts entre l’homme et l’animal.

 

Parcours scientifique

Depuis Novembre 2009. Maitre de conférences/CNRS UMR 6249 Chrono-Environnement (Besançon, UFR Sciences et Techniques).

Septembre 2008-Août 2009. CDD (12 mois). Attaché Temporaire d’Enseignement et de Recherche (Reims, UFR Sciences).

Novembre 2007-Août 2008. CDD (10 mois). Attaché Temporaire d’Enseignement et de Recherche (Reims, UFR Sciences).

Février 2006-Juillet 2007. CDD (18 mois). Postdoctorat CNRS/Région Ile de France. (Paris, Muséum National d’Histoire Naturelle).

Septembre-Décembre 2005. CDD (3 mois). Chargé d’études et d’opérations (INRAP, Grand Est Nord).

2002-2005. Thèse de doctorat, mention Paléoparasitologie (Reims, UFR Pharmacie).

2001-2002. DEA « Environnement et Archéologie », Option Archéozoologie (Paris, Muséum National d’Histoire Naturelle).

2000-2001. Maîtrise de Biologie Cellulaire et Physiologie, Mention Biologie Générale, Sciences de la Terre et de l’Univers (Reims, UFR Sciences).

 

Bibliographie

A- Publications internationales à CL (29 publications)

BOUCHET F., HARTER S., LE BAILLY M. 2003. The state-of-the-art of Paleoparasitological research in the Old World. Mémorias do Instituto Oswaldo Cruz, 98 : 95-101 (IF : 1.363).

HARTER S., LE BAILLY M., JANOT F., BOUCHET F. 2003. First paleoparasitological study of one jar of embalming dejection discovered found to Saqqara (Egypt). Mémorias do Instituto Oswaldo Cruz, 98 : 119-121 (IF : 1.363).

LE BAILLY M., LEUZINGER U., BOUCHET F. 2003. Dioctophymidae Eggs from Coprolites from Neolithic Site of Arbon-Bleiche 3 (Switzerland). Journal of Parasitology, 89 : 1073-1076 (IF : 1,321).

GONCALVES MLC., SILVA V., ANDRADE C., ROCHA G., LE BAILLY M., BOUCHET F., FERREIRA L.F., ARAUJO A. 2004. Amebiasis distribution in the past : first steps in using an immunoassay technique. Transaction of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene, 98 : 88-91 (IF : 2,030).

GONCALVES MLC., SCHNELL C., SIANTO L., BOUCHET F., LE BAILLY M., REINHARD K., FERREIRA LF., ARAUJO A. 2005. Protozoan Infection in Archaeological Material. Journal of Biological Research, 80 : 146-148.

LE BAILLY M., LEUZINGER U., SCHLICHTHERLE H., BOUCHET F. 2005. Diphyllobothrium : Neolithic Parasite ? Journal of Parasitology, 91 (4) : 957-959 (IF : 1,321).

LE BAILLY M., BARBIN V., BALASCESCU A., POPOVICI D., BOUCHET F., PAICHELER JC. 2006. Nouvelle approche taphonomique des coprolithes du Tell d’Harsova (Roumanie) : contribution de la cathodoluminescence. Comptes-Rendus Palévol, 5 : 919-925 (IF : 1,152).

LE BAILLY M., GONCALVES MLC., LEFEVRE C., ROPER D., PYE JW., ARAUJO A., BOUCHET F. 2006. Parasitism in Kansas in the 1800’s – A glimpse to the Past through the analysis of grave sediments from Meadowlark Cemetery. Memorias do Instituto Oswaldo Cruz, 101 (suppl. II) : 53-56 (IF : 1.363).

CHAVES DA ROCHA G., HARTER-LAILHEUGUE S., LE BAILLY M., ARAUJO A., FERREIRA L.F., MAUES DA SERRA-FREIRE N., BOUCHET F. 2006. Paleoparasitological remains revealed by seven historic contexts from “Place d’Armes”, Namur, Belgium. Memorias do Instituto Oswaldo Cruz, 101 (suppl. II) : 43-52 (IF : 1.363).

LE BAILLY M., LEUZINGER U., SCHLICHTHERLE H., BOUCHET F. 2007. « Crise économique » au Néolithique à la transition Pfÿn-Horgen : contribution de la Paléoparasitologie. Anthropozoologica 42 (2) : 175-185.

LE BAILLY M., LEPETZ S., SAMASHEV Z., FRANCFORT H-P., BOUCHET F. 2008. Paleoparasitological study of gastro-intestinal content in horses at a Scythian kurgan (3rd century BC) found in Kazakhstan. Anthropozoologica 43 (2) : 69-75.

LE BAILLY M., GONCALVES MLC., HARTER-LAILHEUGUE S., PRODEO F., ARAUJO A., BOUCHET F. 2008. New finding of Giardia intestinalis (Eukaryote, Metamonad) in Old World archaeological site using immunofluorescence and enzyme linked immunosorbent assays. Memorias do Instituto Oswaldo Cruz, 103 (3) : 298-300 (IF : 1.363).

LE BAILLY M., MOUZE S., CHAVES DA ROCHA G., HEIM J.-L., LICHTENBERG R., DUNAND F., BOUCHET F. 2010. Identification of Taenia sp. in a Mummy from a Christian Necropolis in El-Deir, Oasis of Kharga, Ancient Egypt. Journal of Parasitology, 96 (1) : 213-215 (IF : 1,321).

LE BAILLY M., BOUCHET F. 2010. Ancient dicrocoeliosis : Occurrence, distribution and migration. Acta Tropica, 115 : 175-180 (IF : 2,787).

NEZAMABADI M., HARTER-LAILHEUGUE S., LE BAILLY M. 2011. Paleoparasitology in the Middle-East : State of the research and potential. Tüba-Ar, 14 : 205-213.

LE BAILLY M., LANDOLT M., BOUCHET F. 2012. First World War German Soldier Intestinal Worms : An Original Study of a Trench Latrine in France. Journal of Parasitology, 98 (6) : 1273-1275 (IF : 1,321).

DUFOUR B., LE BAILLY M. 2013. Testing new parasite egg extraction methods in paleoparasitology and an attempt at quantification. International Journal of Paleopathology 3 : 199-203.

KUHN M., MAIER U., HERBIG C., ISMAIL-MEYER K., LE BAILLY M., WICK L. 2013. Methods for the examination of cattle, sheep and goat dung in prehistoric wetland settlements with examples of the sites Alleshausen-Täschenwiesen and Alleshausen-Grundwiesen (around cal 2900 BC) at Lake Federsee, South-west Germany. Environmental Archaeology, 18 (1) : 43-57 (IF : 0.505).

LE BAILLY M., BOUCHET F. 2013. Diphyllobothrium in the Past : review and new records. International Journal of Paleopathology 3 : 182-187.

NEZAMABADI M., AALI A., STOLLNER T., MASHKOUR M., LE BAILLY M. 2013a. Paleoparasitological analysis of samples from the Chehrabad salt mine (Northwestern Iran). International Journal of Paleopathology 3 : 229-233.

NEZAMABADI M., MASHKOUR M., AALI A., STOLLNER T., LE BAILLY M. 2013b. Identification of Taenia sp. in a natural human mummy (third century BC) from the Chehrabad salt mine, Iran. Journal of Parasitology, 99 (3) : 570-572 (IF : 1,321).

REINHARD K., FERREIRA L.F., BOUCHET F., SIANTO L., DUTRA J.M.F., INIGUEZ A., LELES D., LE BAILLY., FUGASSA M., PUCU E., ARAUJO A. 2013. Food, parasites, and epidemiological transitions : a broad perspective. International Journal of Paleopathology 3 : 150-157.

APPELT S., ARMOUGOM F., LE BAILLY M., ROBERT C., DRANCOURT M. 2014. Polyphasic analysis of a Middle Ages coprolite microbiota, Belgium. PlosOne 9 (2) : e88376. doi:10.1371/journal.pone.0088376 (IF : 3.534).

APPELT S., FANCELLO L., LE BAILLY M., RAOULT D., DRANCOURT M., DESNUES Ch. 2014. Viruses in a 14th-century coprolite. Applied and Environmental Microbiology 80(9) : 2648-2655 (IF : 3.678).

LE BAILLY M., ROMON Th., KACKI S. 2014. New evidence of Entamoeba histolytica infections in pre-Columbian and colonial cemeteries in the Caribbean. Journal of Parasitology 100 (5) : 684-686 (IF : 1,258).

LE BAILLY M., LANDOLT M., MAUCHAMP L., DUFOUR B. 2014. Intestinal parasites in First World War German soldiers from "Kilianstollen", Carspach, France. PlosOne 9 (10) : e109543 (IF : 3.534).

DUFOUR B., HUGOT J-P., LEPETZ S., LE BAILLY M. 2015. The horse pinworm (Oxyuris equi) in archaeology during the Holocene : Review of past records and new data. Infection, Genetics and Evolution 33 : 77-83 (IF : 3.264).

COTÉ N.M., DALIGAULT J., PRUVOST M., BENNETT E.A., GORGÉ O., GUIMARAES S., CAPELLI N., LE BAILLY M., GEIGL EM., GRANGE T. 2016. A New High-Throughput Approach to Genotype Ancient Human Gastrointestinal Parasites. PLoS One 11(1) : e0146230 (IF : 3.534).

LE BAILLY M., MAICHER C., DUFOUR B. 2016. Archaeological occurrences and historical review of the human amoeba, Entamoeba histolytica, over the past 6000 years. Infection, Genetics and Evolution 42 : 34-40 (IF : 3.264).

B- Publications nationales avec CL (5 publications)

LE BAILLY M., HARTER S., BOUCHET F. 2003. A l’interface de la biologie et de l’archéologie : la Paléoparasitologie. Archéopages, 11 : 12-17.

LE BAILLY M., BOUCHET F. 2004. Etude parasitologique des coprolithes humains du site néolithique Arbon-Bleiche 3. Die Jungsteinzeitliche Seeufersiedlung Arbon-Bleiche 3,Umwelt und Wirtschaft. Archäologie im Thurgau, Band 12 : 372-377.

LE BAILLY M., BOUCHET F. 2006. La Paléoparasitologie. Les parasites comme marqueurs de la vie des populations anciennes. Studii de Preistorie, 3 : 225-232.

LE BAILLY M., BOUCHET F. 2006. Paléoparasitologie et immunologie : l’exemple d’Entamoeba histolytica. Archéosciences, 30 : 129-135.

NEZAMABADI M., MASHKOUR M., LE BAILLY M. 2013c. Paleoparasitology in the Iranian plateau and the Middle East. Bastanpazhuhi, Persian Journal of Iranian Studies (Archaeology) 12-13 : 102-107.

C- Livres et ouvrages collectifs (4 références)

LE BAILLY M. 2010. La Paléoparasitologie. In S. Thiébault (Ed), Archéologie environnementale de la France. Collection « Archéologie de la France », sous la direction de J.-P. Demoule et J.-P. Jacob, Edition la Découverte, Paris : 32.

LE BAILLY M. 2011. Les parasites dans les lacs nord alpins au Néolithique (3900-2900 BC), et nouvelles données dans la détection des paléoantigènes de Protozoa. Sarrebruck, Editions Universitaires Européennes : 291 pp.

LE BAILLY M., DUFOUR B., BOUCHET F. 2011. La paléoparasitologie en période gallo-romaine. In Gourevich D. (Ed.). Pour une archéologie de la médecine romaine. Paris, De Boccard, collection Pathographie 8 : 67-68.

BOUCHET F., LE BAILLY M. 2011. Os Achados na Europa. In Ferreira et al (Eds). Fundamentos da Paleoparasitologia, Ed. Fiocruz : 377-404.

D- Articles didactiques et non référencés (10 références)

LE BAILLY M., HARTER S., CHAVES DA ROCHA G., BOUCHET F. 2003. Compte-rendu de l’étude paléoparasitologique de Windisch-Breite 1996-1998. In Hagendorn A. et al. (dir.). Zur Frühzeit von Vindonissa : Auswertung der Holzbauten der Grabung Windisch-Breite 1996-1998. Veröffentlichungen der Gesellschaft pro Vindonissa, 18 : 230.

HARTER S., LE BAILLY M., BOUCHET F. 2003. Compte-rendu de l’étude paléoparasitologique des sites de Chevenez Combe Varu et Chevenez Lai Coiratte (Jura, Suisse). In Gonda C. Chevenez, Lai Coiratte un artisanant metallurgique du Haut Moyen-Age. Fouilles 2002. Archéologie et Transjurane, 108 : 33-36.

VERJAT F., HARTER-LAILHEUGUE S., LE BAILLY M., BASSET D., BOUCHET F. 2005. Etude paléoparasitologique menée sur le puits PT471 de Lattes. Lattara, 18 : 327-334.

LE BAILLY M., BOUCHET F. 2006. Etude paléoparasitologique d’une première série d’échantillons provenant des niveaux de bergerie du Néolithique final. In Nicod et al. (Eds). Fouilles archéologiques de la Grande Rivoire à Sassenage (Isère), Rapport de fouille 2004-2006 : 273-274.

LE BAILLY M., BOUCHET F. 2012. Paléoparasitologie. In Evéquoz E., Eschenlohr L., Deslex C., Elyaqtine M. & Bélet-Gonda C. (Eds). Occupations du Haut Moyen Age à Chevenez : inhumations et atelier métallurgique. Cahier d’Archéologie Jurassienne 27 : 214-215.

DUFOUR B., LE BAILLY M. 2012. Bourges, ZAC Avaricum (Cher, 18), rapport de l’analyse paléoparasitologique. In Fondrillon M., Marot E., Troadec J. (Eds.), Evolution d’un quartier urbain de Bourges du 1er s. à nos jours, Volume 4 : pp. 62-87.

GONZALES-VILLAESCUSA R., MARRE A., HUVIG A., LE BAILLY M., BOUCHET F., CHALUMEAU L., DUFOUR B., LEJEUNE O., MALLAM-ISSA O., SANCHEZ F. 2013. La villa gallo-romaine d’Andilly-en-Bassigny (Haute-Marne). Un projet d’étude de l’ager de la cité des Lingons (Andemantunnum-Langres). In Fiches, J.-L., Plana-Mallart, R., Revilla Calvo, V. (Eds.), Paysages ruraux et territoires dans les cités de l’occident romain. Gallia et Hispania. Actes du colloque international AGER IX. Presses universitaires de la Méditerranée, Barcelone : pp. 303-312.

LE BAILLY M. 2013. Le diagnostic parasitologique. In Seiller M. & Werlé M. (Eds.), La Seigneurie d’Andlau, un hôtel aristocratique de la fin du XVIe s. dans le vignoble alsacien. Société d’Histoire et d’Archéologie, Dambach, Barr, Obernai, Editions ID, Bernardswiller : pp. 116-117.

LE BAILLY M. & BOUCHET F. 2013. Compte-rendu de l’étude paléoparasitologique de la fosse F07 (zone 03, secteur 02). In Ingels D. et al, Une occupation médiévale et post-médiévale à Maraîche (Tournai/Esplechin) : Quelles relations avec l’abbaye Saint-Martin de Tournai ? Etudes et Documents Archéologie, Namur, Wallonie, 24 : pp. 129-131.

BOUCHET F. & LE BAILLY M. 2014. Les indices paléoparasitologiques. In Henigfeld Y. & Kuchler Ph. (Eds), L’ilots du palais de justice d’Epinal (Vosges, Formation et développement d’un espace urbain au Moyen-âge et à l’époque moderne. Documents d’Archéologie Française 108. Editions de la Maison des Sciences de l’Homme, Paris : pp. 143-144.

LE BAILLY M. 2014. Soldats et parasites : une autre guerre. ArchéoThéma 35 : 78-80.

E- Actes de colloques publiés (2 références)

BOUCHET F., HARTER S., LE BAILLY M. 2003. Apport de la Paléoparasitologie à la connaissance des pathologies infectieuses dans les sites médiévaux de Belgique et de France. In Noel R. et al. (eds). Les Hommes et leurs vécus matériels au Moyen-âge à la lumière des Sciences et des Techniques. Actes du Colloque de Marche-en-Famenne, 16-20 Octobre 2002 : 99-108.

BOUCHET F., LE BAILLY M. 2008. Palaeoparasitological study of Agnes Sorel, A France Kingdom Lady. In Atoche P., Rodriguez C. & Ramirez A. (Eds). Mummies and Sciences, World Mummies Research. Proceedings of the VI world congress on mummy studies, Teguise, Lanzarote, 20-24 Février 2007. Primera Edition, Santa Cruz de Tenerife : 669-671.