La modélisation dynamique des systèmes écologiques constitue une méthode incontournable pour comprendre, prédire et contrôler la dynamique des écosystèmes semi-naturels, qui fait intervenir des processus complexes à diffé-rentes échelles spatio-temporelles. Le principal objectif de cette thèse est de développer un sous-modèle de simula-tion de la dynamique à moyen et long terme de la végétation herbacée dans les prairies permanentes et les pâturages boisés de l’Arc Jurassien, tenant compte à la fois de la biodiversité et des principaux services écosystémiques (production végétale, stockage du carbone), intégré au modèle dynamique spatialement explicite WoodPaM. Des modèles alternatifs basés sur différentes variables d’état (communautés herbacées, groupes socio-écologiques d’espèces indicatrices, espèces dominantes, stratégies CSR, types fonctionnels, traits fonctionnels moyens) seront développés et calibrés à partir des données observationnelles et expérimentales disponibles, avant d’être appliqués à plusieurs paysages virtuels ou réels, dans le but de comparer les résultats des simulations et d’évaluer leurs performances respectives. La résistance et la résilience des écosystèmes sera évaluée à partir de la simulation de différents scénarios de changements climatiques (réchauffement moyen, vagues de chaleur et de sécheresse), biotiques (pullulations de campagnols) et anthropiques (pratiques agricoles).
