Le projet a pour objectif de mesurer les conséquences des altérations anthropiques de la géomorphologie et de la trophie des zones humides sur le fonctionnement et leur biodiversité. Pour cela, le projet va utiliser des données écologiques actuelles et anciennes, qu’il va combiner avec des analyses diachroniques de carottes de sédiment, pour obtenir une image des changements de la biodiversité végétale et du fonctionnement (teneur en nutriments, minéralisation de la matière organique) qui ont eu lieu dans la dernière centaine d’années dans les zones humides du Doubs et les étangs du plateau jurassien. Les résultats escomptés sont 1) une analyse synchronique de l’état écologique actuelle de ces zones humides, intégrant la relation entre biodiversité et fonctionnement écologique, et 2) une analyse diachronique de la dynamique des ces zones humides qui sera interprétée à la lumière des modifications de la pression anthropique sur la rivière et le massif.