Éline Dubois a le plaisir de vous convier à sa soutenance de thèse, intitulée : Impact des huiles essentielles sur l’antibiorésistance de Pseudomonas aeruginosa cultivé seul ou en co-culture. La soutenance se déroulera le mardi 17 décembre à 14h, bâtiment Bio-Innovation (4 rue Charles Bried, 25000 Besançon). Il est possible de suivre la soutenance en visioconférence (contact : ).
Composition du jury :
Rapportrice : Dr Laetitia Daury
Rapportrice : Pr Karen Moreau
Examinateur : Pr Jean-Marie Perrier-Cornet
Examinateur : Dr Jean-Michel Brunel
Examinateur : Pr Jean-Yves Maillard
Directrice de thèse : Pr Catherine Llanes
Résumé : Pseudomonas aeruginosa est une bactérie opportuniste qui infecte de façon chronique les voies pulmonaires des patients atteints de mucoviscidose (CF). En raison de son antibiorésistance, les patients CF se tournent de plus en plus souvent vers des thérapies alternatives telles que les huiles essentielles (HEs) sans que le bénéfice soit réellement évalué.
Dans ce travail, nous avons identifié les mécanismes de résistance et de détection des composés extraits d’HEs chez P. aeruginosa mais avons aussi pu constater qu’ils pouvaient induire une résistance croisée avec les antibiotiques anti-Pseudomonas. En effet, la souche de référence PA14 développe une résistante induite au cinnamaldéhyde (CNA, extrait de l’HE de cannelle), notamment grâce à la mise en place de mécanismes de défense impliquant les pompes d’efflux actif, dont MexAB-OprM. Cette voie de défense est mise en place grâce à plusieurs régulateurs, en particulier le répresseur NalC, mais aussi le système à deux composants AmgRS qui détecte le stress membranaire causé par le CNA. Nous montrons également que pour permettre à MexAB-OprM de fonctionner de façon optimisée, la bactérie fait des économies de protons qui constituent sa source d’énergie. Pour cela, elle réduit le fonctionnement de l’ATP-synthase, ce qui rend la bactérie hypersensible aux aminosides.
Une deuxième ligne de défense passe par les voies enzymatiques impliquées dans la métabolisation des composés des HEs. Ainsi, le CNA est métabolisé en alcool cinnamique grâce à des aldéhyde/alcool déshydrogénases (dont PA2275), pour être finalement éliminé par les oxydoréductases PA1880-PA1881.
La transposition de ces travaux sur des collections longitudinales de souches CF a montré que la sensibilité aux composés extraits d’HE a tendance à augmenter au cours de la colonisation (alors qu’elle diminue pour les antibiotiques), et que la résistance croisée était plus importante chez les souches de primo-colonisation. De plus, les composés extrait d’HEs perturbent l’équilibre des populations du microbiote pulmonaire, en particulier S. aureus, co-isolé avec P. aeruginosa chez 21% des patients du CHU de Besançon. La combinaison HE/antibiotique ne favorisant pas l’éradication ni de S. aureus, ni de P. aeruginosa, il est préférable de déconseiller l’utilisation de ces composés naturels lorsqu’ils sont utilisés en combinaison avec les antibiotiques.
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