Recherche
Une approche interdisciplinaire
La structuration scientifique en cinq thèmes est issue d’une réflexion collective. Notre unité rassemble des compétences interdisciplinaires pour répondre aux enjeux planétaires soulevés par l’urgence de la crise écologique globale. Des axes de travail transversaux contribuent à la prise en compte de tous les acteurs façonnant notre environnement.
Cinq thèmes de recherche
Les projets de recherche
MUSLI
Face aux défis actuels liés à la pollution et au changement climatique, le projet MUSLI développe une approche pluridisciplinaire visant à mieux comprendre les mécanismes de dégradation des lacs. Original par le croisement de l’écologie, de la chimie et de l’histoire environnementale, ce projet de recherche étudie à la fois les impacts des anciennes munitions immergées et ceux de l’eutrophisation sur les écosystèmes lacustres. Grâce à des méthodes innovantes et à une vision intégrée des enjeux environnementaux, le projet contribuera à protéger durablement les milieux aquatiques.
PCR Dépôts de la région salinoise
Ce programme étudie les dépôts métalliques de l’âge du Bronze autour des sites fortifiés des environs de Salins-les-Bains, pour documenter leurs modalités d’enfouissement et leur rôle dans l’organisation du territoire. Associant prospections ciblées, analyses spatiales et technologies 3D, il offre une compréhension inédite des logiques d’implantation et des pratiques rituelles dans un paysage de moyenne montagne.
NANOHYMPI
L’objectif de ce projet consiste à développer des nanofleurs d’oxyde de fer (maghémite) décorées par des nanoparticules d’or ultra-petites recouvertes de chélateurs (GIONF). Le potentiel de ces nanostructures magnétoplasmoniques pour le traitement de l’athérosclérose guidé par l’imagerie sera évalué par des expériences in vitro et in vivo.
CONFLANDEX
Projet collaboratif et transdisciplinaire associant des universités régionales, nationales et internationales, et des PME régionales (Haute-Saône, Doubs, Territoire de Belfort) sur le traitement des eaux et des boues par des bioprocédés et un volet formation ingénierie de l’eau.
FOR’EST ADN
Ce projet cherche à comprendre le rôle du paysage dans la diffusion des scolytes dans le massif jurassien. Il regroupe des compétences et des champs thématiques variés en écologie, en géographie, en gestion et analyse de données environnementales complexes. Le projet s’inscrit dans l’Observatoire des forêts comtoises, s’appuyant sur l’expertise des chercheurs et des partenaires territoriaux en vue d’apporter des réponses concrètes aux gestionnaires des forêts face au dépérissement actuel.
PIPAF
L’étude des dynamiques forestières passées via des approches rétrospectives de paléoécologie ou d’écologie historique offre un recul historique nécessaire pour considérer la vulnérabilité et la résilience des forêts, car elles documentent l’état des forêts avant et après une perturbation.
Dans le cadre du projet PIPAF, il sera procédé à la recherche de pullulations du Bostryche typographe (Ips typographus) à travers l’examen de documents d’archives ainsi qu’une approche paléoécologique, incluant l’analyse de macro-restes et d’ADN ancien.
PARADE
Les phages sont des virus qui tuent spécifiquement les bactéries. Ils jouent un rôle crucial dans le contrôle des populations bactériennes dans les écosystèmes. Par un phénomène de coévolution, les bactéries ont développé une grande diversité de défenses anti-phages. Nous émettons l’hypothèse que le succès de certains clones épidémiques qui sont répandus à l’échelle mondiale doivent leur succès, au moins en partie, à leur plus grande résistance aux phages.
ODEON
Les sécheresses et vagues de chaleur fragilisent les forêts françaises, surtout en Bourgogne-Franche-Comté, où les scolytes ravagent épicéas et sapins. Pour mieux gérer ces risques liés au climat, il faut identifier rapidement ces insectes. Le projet ODEON développe des outils d’analyse innovants basés sur l’intelligence artificielle afin d’améliorer le suivi de la biodiversité et la gestion forestière.
RAMA
Les cancers solides sont traités avec médicaments qui attaquent l’ADN des cellules cancéreuses et des bactéries du microbiote digestif. Avec le projet RAMA, nous souhaitons tester si les médicaments anticancéreux favorisent le développement de bactéries résistantes aux antibiotiques en utilisant différents modèles : chez des patients traités par des cytotoxiques, dans un modèle in vitro de microbiote digestif et un modèle murin de microbiote humanisé.
MEHTA
Avec le changement climatique, une gestion raisonnée des ressources en eau devient cruciale pour l’irrigation. L’usage des eaux usées traitées s’impose en agriculture, mais les effets de l’ingestion de légumes irrigués par ces eaux sur le microbiote intestinal et la résistance aux antibiotiques restent inconnus. Pour y remédier, l’ANR/INSERM finance le projet MEHTA dans le cadre de France 2030, un programme de recherche prioritaire sur la résistance aux antibiotiques.
Trois groupes de travail
E.A.U.
Évaluer l’impact du changement climatique et des activités humaines sur les écosystèmes aquatiques et la gestion des ressources en eau.
Observatoires eLTER Jura
Suivi à long terme et labellisation des sites observatoires du massif du Jura.
Pôles
Vulnérabilité, résilience et capacités d’adaptation au changements globaux dans les hautes latitudes.