Thibault BOURDIN

Site Hauts du Chazal
UMR 6249 Chrono-environnement
19 rue Ambroise Paré
25030 Besançon cedex
France

Thibault Bourdin

Postdoctorant
PATHOGENES

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Référent⋅e Chrono :

Didier Hocquet

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Sciences de l’environnement – Biologie moléculaire – Santé – Bactériologie – Épidémiologie – Écotoxicologie – Antibiorésistance

Présentation

Chercheur postdoctoral au sein du laboratoire du professeur Didier Hocquet (Chrono-environnement / CHU de Besançon, France), j’étudie les effets de l’antibiorésistance bactérienne sur le microbiote intestinal, en lien avec la consommation de cultures irriguées par des eaux usées traitées. Ce travail s’inscrit dans le projet MEHTA (Managing Environmental Hotspots and Transmission of AMR), porté par le professeur Edward Topp et financé par l’ANR dans le cadre du Programme Prioritaire de Recherche (PPR) sur la résistance aux antibiotiques.

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Publications

Article dans une revue

2024

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Thibault Bourdin, Marie-Ève Benoit, Michèle Prévost, Dominique Charron, Caroline Quach, et al.. Disinfection of sink drains to reduce a source of three opportunistic pathogens, during Serratia marcescens clusters in a neonatal intensive care unit. PLoS ONE, 2024, 19 (6), pp.e0304378. ⟨10.1371/journal.pone.0304378⟩. ⟨hal-05009086⟩
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https://hal.science/hal-05009086/file/Bourdin%202024%2C%20Disinfection%20of%20sink%20drains%20to%20reduce%20a%20source%20of%20three%20opportunistic%20pathogens%2C%20during%20Serratia%20marcescens%20clusters%20in%20a%20neonatal%20intensive%20care%20unit.pdf BibTex

2023

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Thibault Bourdin, Marie-Ève Benoit, Alizée Monnier, Emilie Bédard, Michèle Prévost, et al.. Serratia marcescens Colonization in a Neonatal Intensive Care Unit Has Multiple Sources, with Sink Drains as a Major Reservoir. Applied and Environmental Microbiology, 2023, 89 (5), ⟨10.1128/aem.00105-23⟩. ⟨hal-05009055⟩
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https://hal.science/hal-05009055/file/Bourdin%202023%2C%20Serratia%20marcescens%20Colonization%20in%20a%20Neonatal%20Intensive%20Care%20Unit%20Has%20Multiple%20Sources%2C%20with%20Sink%20Drains%20as%20a%20Major%20Reservoir.pdf BibTex
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Thibault Bourdin, Marie-Ève Benoit, Emilie Bédard, Michèle Prévost, Caroline Quach, et al.. High-Throughput Short Sequence Typing Schemes for Pseudomonas aeruginosa and Stenotrophomonas maltophilia Pure Culture and Environmental DNA. Microorganisms, 2023, 12 (1), pp.48. ⟨10.3390/microorganisms12010048⟩. ⟨hal-05009059⟩
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https://hal.science/hal-05009059/file/Bourdin%202024%2C%20High-Throughput%20Short%20Sequence%20Typing%20Schemes%20for%20Pseudomonas%20aeruginosa%20and%20Stenotrophomonas%20maltophilia%20Pure%20Culture%20and%20Environmental%20DNA.pdf BibTex

2022

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Roxanne Bérubé, Molly Lefebvre-Raine, Charles Gauthier, Thibault Bourdin, Pauline Bellot, et al.. Comparative toxicity of conventional and unconventional oils during rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) embryonic development: From molecular to health consequences. Chemosphere, 2022, 288, pp.132521. ⟨10.1016/j.chemosphere.2021.132521⟩. ⟨hal-05008927⟩
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https://hal.science/hal-05008927/file/Berube%202022%2C%20Comparative%20toxicity%20of%20conventional%20and%20unconventional%20oils%20during%20rainbow%20trout%20%28Oncorhynchus%20mykiss%29%20embryonic%20development%20From%20molecular%20to%20health%20consequences.pdf BibTex

2021

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Roxanne Bérubé, Charles Gauthier, Thibault Bourdin, Marilou Bouffard, Gaëlle Triffault-Bouchet, et al.. Lethal and sublethal effects of diluted bitumen and conventional oil on fathead minnow (Pimephales promelas) larvae exposed during their early development. Aquatic Toxicology, 2021, 237, pp.105884. ⟨10.1016/j.aquatox.2021.105884⟩. ⟨hal-05008913⟩
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https://hal.science/hal-05008913/file/Berube%202021%2C%20Lethal%20and%20sublethal%20effects%20of%20diluted%20bitumen%20and%20conventional%20oil%20on%20fathead%20minnow%20%28Pimephales%20promelas%29%20larvae%20exposed%20during%20their%20early%20development.pdf BibTex
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Thibault Bourdin, Alizée Monnier, Marie-Ève Benoit, Emilie Bédard, Michèle Prévost, et al.. A High-Throughput Short Sequence Typing Scheme for Serratia marcescens Pure Culture and Environmental DNA. Applied and Environmental Microbiology, 2021, 87 (24), ⟨10.1128/AEM.01399-21⟩. ⟨hal-05009041⟩
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https://hal.science/hal-05009041/file/Bourdin%202021%2C%20A%20High-Throughput%20Short%20Sequence%20Typing%20Scheme%20for%20Serratia%20marcescens%20Pure%20Culture%20and%20Environmental%20DNA.pdf BibTex

Poster de conférence

2018

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Mylène Toubiana, Agnès Masnou, J.L. Seidel, Benjamin Durand, Thibault Bourdin, et al.. Exploration de l’antibiorésistance dans un réservoir d’eau potable : l’aquifère karstique du Lez. Société Française de Microbiologie (SFM) 2018, Oct 2018, Paris, France. ⟨hal-02407828⟩
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2017

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Patricia Licznar-Fajardo, Marina Hery, Christelle Batiot-Guilhe, T. Bourdin, A. Masnou, et al.. Exploration de l'antibiorésistance dans des communautés bactériennes de l'aquifère karstique du Lez. VIIIe Colloque de l'Association Francophone d'Ecologie Microbienne, Oct 2017, Camaret sur Mer, France. ⟨hal-02111953⟩
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