Sylvie DAMY

Chrono-environnement - UMR 6249
Campus de la Bouloie
16 rue de Gray
25030 Besançon

Sylvie Damy

Assistant Professor
DYNABIO, GEODE, PATHOGENES, POLLUTION, SOPAST

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+33 (0)6 89 56 78 38, room K2

Computing, databases, research data, Open Science

My research theme is research data management. As early as 2013, as part of the OSU THETA, I launched the dat@OSU project, which aimed to reference research data on a specific portal.
It will be awarded the ‘Data Workshop’ label in 2022. I’m also working on design of observatory-type databases in collaboration with two with two members of DISC-FEMTO-ST.

Current projects: dat@UBFC data workshop, Méta-Obs, Comtoises sentinel forest observatory

 

Journal articles

2021

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Eric Quinton, Christine Jacques Plumejeaud, Sylvie Damy. Créer de l’open source, et après ?: La création d’un logiciel, qui répond à un besoin très spécifique n’est pas un acte isolé. Retour sur l’éco-système de la diffusion et de l’appropriation d’un outil à INRAe. La collection numérique, 2021, 13, pp.60. ⟨hal-03150968⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03150968/file/N__13_-_Vive_le_Numerique_libre__fevrier_2021_%20%5BPages%2060%20-%2061%5D.pdf BibTex

2019

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Christine Plumejeaud-Perreau, Eric Quinton, Cécile Pignol, Hector Linyer, Julien Ancelin, et al.. Towards better traceability of field sampling data. Computers & Geosciences, 2019, 129, pp.82-91. ⟨10.1016/j.cageo.2019.04.009⟩. ⟨hal-02125207⟩
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https://hal.science/hal-02125207/file/Plumejeaud_QRcode_Computes_Geosciences_17032019b.pdf BibTex

2017

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Jenny Knapp, Sylvie Damy, Jonathan Brillaud, Jean-Daniel Tissot, Jérémy Navion, et al.. EWET: Data collection and interface for the genetic analysis of Echinococcus multilocularis based on EmsB microsatellite. PLoS ONE, 2017, 12 (10), pp.e0183849. ⟨10.1371/journal.pone.0183849⟩. ⟨hal-01667697⟩
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2014

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Amandine Charbonnier, Jenny Knapp, Florent Demonmerot, Solange Bresson-Hadni, Francis Raoul, et al.. A new data management system for the French National Registry of human alveolar echinococcosis cases.. Parasite, 2014, 21, pp.69. ⟨10.1051/parasite/2014075⟩. ⟨hal-01112756⟩
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Conference papers

2020

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Eric Quinton, Christine Plumejeaud-Perreau, Sylvie Damy. Identification de clés pour le succès de projets de gestion informatisée de données environnementales à partir du logiciel Collec-Science. INFORSID, Jun 2020, Dijon, France. pp.35-50. ⟨hal-02615072⟩
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https://hal.science/hal-02615072/file/modele_developpement_logiciel_donnees_labos%20%282%29.pdf BibTex

2018

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Eric Quinton, Christine Plumejeaud-Perreau, Hector Linyer, Julien Ancelin, Cécile Pignol, et al.. Gestion d’échantillons pour la recherche scientifique avec Collec-Science. 36. Inforsid 2018, May 2018, Nantes, France. ⟨hal-02738009⟩
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2017

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Marie-Laure Betbeder, Sylvie Damy, Bénédicte Herrmann. Pour une gestion des données de recherche en environnement : l'ontologie méta-observatoire. Atelier VADOR : Valorisation et Analyse des Données de la Recherche; INFORSID 2017, Jun 2017, Toulouse, France. pp.26-40. ⟨hal-01858242⟩
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https://hal.science/hal-01858242/file/MetaObs_Vador_2017.pdf BibTex

2016

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Jenny Knapp, Umhang Gérald, Benoit Valot, Francis Raoul, Sylvie Damy, et al.. Methods in genetics to investigate E. multilocularis transmission patterns. Research and methods in ecohealth and conservation, GDRI Ecosystem Health and Environmental Disease Ecology, Nov 2016, Kunming, China. ⟨hal-01367365⟩
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2013

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Sylvie Damy, Jean-Jacques Girardot, Bénédicte Herrmann, Cyril Masselot. Prospects of territorial intelligence tool Catalyse according to governance. 12th Annual International Conference of Territorial Intelligence "Innovación Social y nuevos modos de gobernanza para la transición socio-ecológica", Nov 2013, Spain. ⟨halshs-00931717⟩
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Sylvie Damy, Bénédicte Herrmann. Modélisation informatique de plateformes d'enquêtes participatives pour l'observation de la transition socio-écologique. International Conference of Territorial Intelligence "Territorial Intelligence, Socio-Ecological Transition and Resilience of the Territories". 30-31 May 2013, May 2013, Besançon-Dijon, France. ⟨halshs-00827044⟩
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2012

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Sylvie Damy, Bénédicte Herrmann. Modelling of the TICS Catalyse : Definition of a basic vocabulary. International Conference of Territorial Intelligence "Vulnerabilities and Resilience between Local and Global". 4th - 7th 2012, Jun 2012, Salerno, European Union. 4p. ⟨halshs-00813727⟩
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https://shs.hal.science/halshs-00813727/file/Salerno_2012-Damy-Herrmann-En.pdf BibTex
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Sylvie Damy, Bénédicte Herrmann. Modelling of the TICS Catalyse : Realization of a project. Annual International Conference of Territorial intelligence of INTI, "Territorial intelligence and globalization tensions, transition and transformation", Oct 2012, La Plata, Argentina. 4p. ⟨halshs-00830015⟩
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https://shs.hal.science/halshs-00830015/file/La_Plata_2012-Damy-Herrmann-En.pdf BibTex
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Sylvie Damy, Bénédicte Herrmann-Philippe. Modelling of the Tics Catalyse: realization of an investigation.. 11th Annual International Conference of Territorial intelligence of INTI, "Territorial intelligence and globalization tensions, transition and transformation", Oct 2012, La Plata, Argentina. ⟨halshs-00941210⟩
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2011

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Sylvie Damy, Bénédicte Herrmann, Jean-Jacques Girardot. Les rôles dans les SCIT. 10th International Conference of territorial intelligence "Sustainable economics within the new culture of development", Sep 2011, Liège, Belgique. ⟨halshs-01149431⟩
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Sylvie Damy. Méthode d'observation territoirale CATALYSE, action Modelling et l'approche MDA (Model Driven Architecture), modélisation des questionnaires dans le SCIT. Modélisation des aspects communautaires des SCIT. International Conference "Sustainable economics within the new culture of development". ENTI. September 12th-14th 2011, Sep 2011, Liège, Belgique. ⟨halshs-00803697⟩
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Sylvie Damy, B. Herrmann, Jean-Jacques Girardot. Meta-model of a Territorial Intelligence Community. International Conference "Sustainable economics within the new culture of development". ENTI. September 12th-14th 2011, Sep 2011, Liège, Belgium. ⟨halshs-01149427⟩
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2010

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Sylvie Damy, Bénédicte Herrmann-Philippe. TICS modelling : Conception of questionnaire. "Grand Ouest" days of Territorial Intelligence IT-GO, ENTI., Mar 2010, Nantes-Rennes, France. 7p. ⟨halshs-00784951⟩
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https://shs.hal.science/halshs-00784951/file/ITGO_2010-paper-damy-En.pdf BibTex
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Jean-Jacques Girardot, Sylvie Damy, B. Herrmann. SCIT modelling : Conception of questionnaire. "Grand Ouest" days of Territorial Intelligence IT-GO, ENTI. Nantes-Rennes, mar. 2010, Mar 2010, Nantes-Rennes, France. ⟨halshs-01164300⟩
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2009

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Sylvie Damy, Bénédicte Herrmann-Philippe, Jean-Jacques Girardot, Cyril Masselot, Rémi Thomas. First steps in the modelling of Territorial Intelligence Community Systems. 8th Annual International Conference of Territorial Intelligence of ENTI "Territorial Intelligence and Culture of Development", Salerno, nov. 2009, Nov 2009, Salerno, Italy. ⟨halshs-00847743⟩
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Odile Peyron, Amandine Bordon, Nathalie Combourieu-Nebout, Anne Vignot, Sylvie Damy, et al.. Une nouvelle base de données polliniques actuelles: une étape majeure pour les quantifications climatiques et les reconstructions de végétation et de biodiversité. 21ème symposium APLF, Prospectives en Paléontologie et Palynologie, Jun 2009, Lille, France. ⟨hal-00419946⟩
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2008

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Sylvie Damy, Bénédicte Herrmann-Philippe. Metadata for the caENTI.. In International Conference of Territorial Intelligence, Besançon 2008., Oct 2008, Besançon, France. pp.10. ⟨halshs-00516253⟩
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https://shs.hal.science/halshs-00516253/file/INTI-2008-Besancon-Damy.pdf BibTex
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Sylvie Damy, Bénédicte Herrmann, Cyril Masselot, Eddy Petit, Jonathan Benilan, et al.. Progress and prospects of Catalyse tools Integration.. In International Conference of Territorial Intelligence, Besançon 2008., Oct 2008, Besançon, France. pp.10. ⟨halshs-00516138⟩
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Odile Peyron, Amandine Bordon, Anne Vignot, Sylvie Damy, Nathalie Combourieu-Nebout, et al.. A modern pollen−climate database as a tool for quantitative climate and vegetation reconstructions. 12th International Palynological Congress IPC−XII, Aug 2008, Bonn, Germany. ⟨hal-00419948⟩
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2007

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Jean-Jacques Girardot, Cyril Masselot, Sylvie Damy, Bénédicte Hermann, Isabelle Jacques, et al.. Progress and prospects of the wp6 “tools for actors”. In International Conference of Territorial Intelligence "Territorial Intelligence and Governance. Participatory Action-Research and Territorial Development", Oct 2007, Huelva, Spain. p. 81-104. ⟨halshs-00487039⟩
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Other publications

2021

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Albane Rossi, Bernard Debray, Raphael Melior, Rachel Prost, Nadir Tabbou, et al.. Sortons nos données du placard pour les valoriser. 2021. ⟨hal-03541417⟩
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2009

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Jean-Jacques Girardot, Cyril Masselot, Sylvie Damy, Hermann Bénédicte, Celia Sanchez Lopez, et al.. Specifications for a Territorial Information System, deliverable 60 of caENTl. 2009, pp.362. ⟨halshs-00487985⟩
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Poster communications

2017

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Christine Plumejeaud-Perreau, Hector Linyer, Cécile Pignol, Sébastien Cipiere, Eric Quinton, et al.. QR-CODE PROJECT : Towards better traceability of field sampling data. International Long Term Ecological Research Network (ILTER) & Zones Ateliers & Critical Zone Observatory Networks (LTER-France) Joint conference, Oct 2017, Nantes, France. , 1 p., 2017. ⟨hal-02788457⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02788457/file/2017_sept_QRCODE_LTER_1.pdf BibTex

2010

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Sylvie Damy, Bénédicte Herrmann, Jean-Jacques Girardot. Modelling of territorial intelligence community systems. 9th International Conference of Territorial Intelligence of ENTI "Ecological and Social Innovation", Nov 2010, Strasbourg, France. ⟨halshs-00947886⟩
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Reports

2009

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Jean-Jacques Girardot, Cyril Masselot, Celia Sanchez Lopez, Blanca Miedes Ugarte, Sylvie Damy, et al.. Specifications for Territorial Intelligence Community Systems. [Research Report] Delivrable n°60, of the European Research Coordination Actionof the European Network of Territorial Intelligence, FP6 – 2004 – CITIZENS – 5 – 8.2.2 - CA 029127 - caENTI. 2009, 362 p. ⟨halshs-01148842⟩
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