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2025
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- Audrey Goman, Bérengère Ize, Katy Jeannot, Camille Pin, Delphine Payros, et al.. Uncovering a new family of conserved virulence factors that promote the production of host‐damaging outer membrane vesicles in gram‐negative bacteria. Journal of Extracellular Vesicles, 2025, 14 (1), pp.e270032. ⟨10.1002/jev2.70032⟩. ⟨hal-04907628⟩
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- Thiziri Tala-Ighil, Dea Garcia-Hermoso, Frédéric Dalle, Sophie Cassaing, Juliette Guitard, et al.. Epidemiology and Prognostic Factors Associated With Mold-Positive Blood Cultures: 10-Year Data From a French Prospective Surveillance Program (2012–2022). Clinical Infectious Diseases, In press, pp.ciae594. ⟨10.1093/cid/ciae594⟩. ⟨pasteur-04882051⟩
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2024
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- Marc Arbyn, Kate Cuschieri, Jesper Bonde, Rob Schuurman, Clementina Cocuzza, et al.. Criteria for second generation comparator tests in validation of novel HPV DNA tests for use in cervical cancer screening. Journal of Medical Virology, 2024, 96 (9), ⟨10.1002/jmv.29881⟩. ⟨hal-04752113⟩
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- Anne-Pauline Bellanger, Gbaguidi-Haore Houssein, Ana Berceanu, Laura Gouzien, Chaima El Machhour, et al.. Use of the Mucorales qPCR on blood to screen high-risk hematology patients is associated with better survival. Medical Mycology, 2024, ⟨10.1093/mmy/myae030⟩. ⟨hal-04524410⟩
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- Kevin Bouiller, Houssein Gbaguidi-Haore, Didier Hocquet, Thomas Crépin, Daniel Wendling, et al.. The effects of switching from ceftriaxone to cefotaxime on the occurrence of third-generation cephalosporin-resistant Enterobacterales: A stepped-wedge cluster randomized trial. Infectious Diseases Now, 2024, 54 (1), pp.104806. ⟨10.1016/j.idnow.2023.104806⟩. ⟨hal-04426815⟩
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- Peter R. Brown, Patrick Giraudoux, Jens Jacob, Geoffroy Couval, Christian Wolff. Multi-stakeholder working groups to improve rodent management outcomes in agricultural systems. International Journal of Pest Management, 2024, pp.1-17. ⟨10.1080/09670874.2024.2363877⟩. ⟨hal-04623119⟩
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- Pui Yan Jenny Chung, Sharonjit Dhillon, Alice Baraquin, Yuliya Tkachenka, Killian Jacquot, et al.. Intra‐ and interlaboratory reproducibility evaluation toward international validation status of the AmpFire assay. Journal of Medical Virology, 2024, 96 (6), ⟨10.1002/jmv.29688⟩. ⟨hal-04669506⟩
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- Aurélien Dinh, Alexandre Bleibtreu, Clara Duran, Frédérique Bouchand, Alexie Bosch, et al.. National Cohort of Compassionate Use of Meropenem–Vaborbactam: No Benefit over Meropenem for Pseudomonas aeruginosa. Antibiotics, 2024, 13 (12), pp.1152. ⟨10.3390/antibiotics13121152⟩. ⟨inserm-04874028⟩
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- Eline Dubois, Vladimir Spasovski, Catherine Llanes, Patrick Plésiat. Role of the two-component system AmgRS in early resistance of Pseudomonas aeruginosa to cinnamaldehyde. Microbiology Spectrum, In press, ⟨10.1128/spectrum.01699-24⟩. ⟨hal-04830034⟩
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- Mohamed Gharbi, Patrick Giraudoux. Cystic echinococcosis (Echinococcus granulosus sensu lato infection) in Tunisia, a One Health perspective for a future control programme. Parasite, 2024, 31, pp.30. ⟨10.1051/parasite/2024029⟩. ⟨hal-04612253⟩
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- Patrick Giraudoux, Geoffroy Couval. Contrôle multifactoriel des populations de campagnols dans un socio-écosystème : une application pratique au massif du Jura, France. Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France, 2024, 177, ⟨10.3406/bavf.2024.71113⟩. ⟨hal-04861483⟩
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- Patrick Giraudoux, Ève Afonso, Céline Clauzel, Cécile Callou, Li Li. Conservation du Rhinopithèque de Biet (Rhinopithecus bieti) et tourisme animalier : quels enjeux ?. Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France, 2024, epub, pp.1-16. ⟨10.3406/bavf.024.71106⟩. ⟨hal-04757966v2⟩
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- Patrick Giraudoux, Pierre-Marie Badot. Programmes d’action nitrates : les résultats ne sont à la hauteur ni des attentes ni des enjeux. La Grande Conversation, 2024. ⟨hal-04391068⟩
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- Clément Grandhay, Emma Prétot, Victor Klaba, Hélène Celle, Anne-Cécile Normand, et al.. Yeast Biodiversity of Karst Waters: Interest of Four Culture Media and an Improved MALDI-TOF MS Database. Microbial ecology, 2024, 87 (1), pp.26. ⟨10.1007/s00248-023-02336-1⟩. ⟨hal-04426796⟩
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- Ani Horikian, Audrey Jeanvoine, Abdallah Amarache, Morgane Tourtet, Jérôme Ory, et al.. High-risk clones of Pseudomonas aeruginosa contaminate the drinking water networks of French cities. npj Clean Water, 2024, 7 (1), pp.35. ⟨10.1038/s41545-024-00323-8⟩. ⟨hal-04612386⟩
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- Elise Jacquin, Maëlle Saunier, Quentin Lepiller, Franck Monnien, Frédéric Mauny, et al.. The level of expression of HPV16 early transcripts is not associated with the natural history of cervical lesions. Journal of Medical Virology, 2024, 96 (9), ⟨10.1002/jmv.29875⟩. ⟨hal-04752110⟩
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- Manon Janet-Maitre, Viviana Job, Maxime Bour, Mylène Robert-Genthon, Sabine Brugière, et al.. Pseudomonas aeruginosa MipA-MipB envelope proteins act as new sensors of polymyxins. mBio, 2024, 15 (3), pp.e0221123. ⟨10.1128/mbio.02211-23⟩. ⟨hal-04732591⟩
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- Vincent Jean-Pierre, Pauline Sorlin, Alix Pantel, Raphaël Chiron, Jean-Philippe Lavigne, et al.. Cefiderocol susceptibility of Achromobacter spp.: study of an accurately identified collection of 230 strains. Annals of Clinical Microbiology and Antimicrobials, 2024, 23 (1), pp.54. ⟨10.1186/s12941-024-00709-z⟩. ⟨hal-04874108⟩
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- Vincent Jean-Pierre, Pauline Sorlin, Katy Jeannot, Raphaël Chiron, Jean-Philippe Lavigne, et al.. Commercially available tests for determining cefiderocol susceptibility display variable performance in the Achromobacter genus. Annals of Clinical Microbiology and Antimicrobials, 2024, 23 (1), pp.78. ⟨10.1186/s12941-024-00731-1⟩. ⟨hal-04873210⟩
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- Séverine Lallemand, Jorge Oyhenart, Benoit Valot, Romain Borne, Louis Bohard, et al.. Challenging the phylogenetic relationships among Echinococcus multilocularis isolates from main endemic areas. International Journal for Parasitology, 2024, 54 (11), pp.569-582. ⟨10.1016/j.ijpara.2024.05.004⟩. ⟨anses-04862405⟩
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- Vincent Le-Moing, Éric Bonnet, Vincent Cattoir, Catherine Chirouze, Laurène Deconinck, et al.. Antibiotic therapy and prophylaxis of infective endocarditis – A SPILF-AEPEI position statement on the ESC 2023 guidelines. Infectious Diseases Now, 2024, 55 (1), pp.105011. ⟨10.1016/j.idnow.2024.105011⟩. ⟨hal-04834189⟩
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- Adeline Loyau, Rayan Bouchali, Hugo Sentenac, Dirk Schmeller. The commensal skin microbiome of amphibian mountain populations and its association with the pathogen Batrachochytrium dendrobatidis. Environmental Microbiology, 2024, 26 (10), ⟨10.1111/1462-2920.16699⟩. ⟨hal-04731578⟩
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- Abdou Malik da Silva, Eve Afonso, Francis Raoul, Patrick Giraudoux, Marina Mergey, et al.. Assessing the role of individual foxes in environmental contamination with Echinococcus multilocularis through faecal samples. International Journal for Parasitology, 2024, 54 (7), pp.321-332. ⟨10.1016/j.ijpara.2024.03.003⟩. ⟨hal-04603452⟩
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- H. Marchandin, L. Dubreuil, Marlène Amara, Guillaume Aubin, François Caron, et al.. Comment on “Antimicrobial susceptibility of Bacteroides fragilis group organisms in Hong Kong, 2020–2021”. Anaerobe, 2024, 90, pp.102910. ⟨10.1016/j.anaerobe.2024.102910⟩. ⟨hal-04873136⟩
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- Daniela Matuozzo, Estelle Talouarn, Astrid Marchal, Peng Zhang, Jeremy Manry, et al.. Correction: Rare predicted loss-of-function variants of type I IFN immunity genes are associated with life-threatening COVID-19. Genome Medicine, 2024, 16 (1), pp.6. ⟨10.1186/s13073-023-01278-0⟩. ⟨hal-04600854⟩
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- Mana Momenilandi, Romain Lévy, Steicy Sobrino, Jingwei Li, Chantal Lagresle-Peyrou, et al.. FLT3L governs the development of partially overlapping hematopoietic lineages in humans and mice. Cell, 2024, 187 (11), pp.2817-2837.e31. ⟨10.1016/j.cell.2024.04.009⟩. ⟨pasteur-04589107⟩
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- Juliette Node, Fanny Dor, Line Puget, Rajeev Ramanah, Sophie Cot, et al.. Prevalence and significance of HPV DNA detection below the clinical threshold of the commercial kit Alinity m HR‐HPV assay (Abbott). Journal of Medical Virology, 2024, 96 (2), ⟨10.1002/jmv.29465⟩. ⟨hal-04602000⟩
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- Yu Okazaki, Tamon Kusumoto, Stephane Roux, Ryoichi Hirayama, Michel Fromm, et al.. Increase of OH radical yields due to the decomposition of hydrogen peroxide by gold nanoparticles under X-ray irradiation. RSC Advances, 2024, 14 (14), pp.9509-9513. ⟨10.1039/d4ra00208c⟩. ⟨hal-04626333⟩
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- Olivier Paccoud, Marie Desnos-Ollivier, Sophie Cassaing, Karine Boukris-Sitbon, Alexandre Alanio, et al.. Cryptococcus neoformans Infections Differ Among Human Immunodeficiency Virus (HIV)–Seropositive and HIV-Seronegative Individuals: Results From a Nationwide Surveillance Program in France. Open Forum Infectious Diseases, 2024, 11 (2), pp.ofad658. ⟨10.1093/ofid/ofad658⟩. ⟨hal-04473848⟩
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- Jean-Luc Prétet, Antoine Touzé, Lionel Pazart, Guillaume Boiteux, Véronique Fournier, et al.. Anogenital distribution of mucosal HPV in males and females before and after renal transplantation. Infectious Diseases Now, 2024, 54 (1), pp.104830. ⟨10.1016/j.idnow.2023.104830⟩. ⟨hal-04523363⟩
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- Jean‐luc Prétet, Alice Baraquin, Pui Yan Jenny Chung, Line Puget, Sharonjit Dhillon, et al.. The Sansure® Human Papillomavirus DNA Diagnostic Kit offers excellent reproducibility performance for the detection of high‐risk HPV. Journal of Medical Virology, 2024, 96 (10), ⟨10.1002/jmv.29961⟩. ⟨hal-04752090⟩
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- Line Puget, Juliette Node, Blandine Caël, Jamal Bamoulid, Alain Coaquette, et al.. Urinary cytomegalovirus excretion: The unresolved issues. Annales Pharmaceutiques Françaises, 2024, ⟨10.1016/j.pharma.2024.03.004⟩. ⟨hal-04669512⟩
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- Steffi Rocchi, Emeline Scherer, P. Lewis White, Audrey Guitton, Alexandre Alanio, et al.. Interlaboratory assays from the fungal PCR Initiative and the Modimucor Study Group to improve qPCR detection of Mucorales DNA in serum: one more step toward standardization. Journal of Clinical Microbiology, In press, pp.e0152524. ⟨10.1128/jcm.01525-24⟩. ⟨hal-04862485⟩
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- Camille Sandor, Florence Matutini, Anouk Decors, Olivier Cardoso, Hugo Sentenac, et al.. Biosécurité en milieu humide : bonnes pratiques d’intervention sur les amphibiens sauvages. Naturae, 2024, 14, ⟨10.5852/naturae2024a14⟩. ⟨hal-04713872⟩
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- Hugo Sentenac, Dirk S Schmeller, Solène Caubet, Adélaïde Carsin, Rémi Guillet, et al.. Biofilms inactivate the free-living stage of Batrachochytrium dendrobatidis, the most destructive pathogen for vertebrate diversity. The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2024, 18 (1), pp.wrae189. ⟨10.1093/ismejo/wrae189/7777700⟩. ⟨hal-04723944v2⟩
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- Céline Slekovec, Quentin Lepiller, Raphaël Anxionnat, Sophie Mouillet, David Ferreira, et al.. French healthcare students and antibiotics: are they ready to promote their appropriate use?. JAC-Antimicrobial Resistance, 2024, 6 (1), pp.dlad147. ⟨10.1093/jacamr/dlad147⟩. ⟨hal-04426745⟩
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- Vida Terzić, Joe Miantezila Basilua, Nicolas Billard, Lucie de Gastines, Drifa Belhadi, et al.. Cardiac Adverse Events and Remdesivir in Hospitalized Patients with Coronavirus Disease 2019 (COVID-19): A Post Hoc Safety Analysis of the Randomized DisCoVeRy Trial. Clinical Infectious Diseases, 2024, ⟨10.1093/cid/ciae170⟩. ⟨hal-04529469v2⟩
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- Noémie Tissot, Louis Bohard, Jenny Knapp, Gérald Umhang, Coralie Barrera, et al.. Échinococcose kystique dans les Hautes-Alpes : action conjointe de prévention au travail et d’enquête épidémiologique chez le chien. Archives des Maladies Professionnelles et de L'Environnement, 2024, 85 (2-3), pp.102285. ⟨10.1016/j.admp.2024.102285⟩. ⟨anses-04597836⟩
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- Marco Vecchiato, Hugo Sentenac, Jenny E Jaffe, Anthony W Sainsbury. Health Effects of Patagial Wing Tags in Red Kites (Milvus milvus ) in the UK. Journal of wildlife diseases, 2024, 60 (3), pp.714-720. ⟨10.7589/JWD-D-23-00011⟩. ⟨hal-04638012⟩
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2023
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- Olivier Adotévi, Dewi Vernerey, Pascale Jacoulet, Aurélia Meurisse, Caroline Laheurte, et al.. Safety, Immunogenicity, and 1-Year Efficacy of Universal Cancer Peptide–Based Vaccine in Patients With Refractory Advanced Non–Small-Cell Lung Cancer: A Phase Ib/Phase IIa De-Escalation Study. Journal of Clinical Oncology, 2023, 41 (2), pp.373-384. ⟨10.1200/JCO.22.00096⟩. ⟨hal-04157792⟩
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- Benoit Bailly, Maxime Lecheneaut, Houssein Gbaguidi-Haore, Catherine Chirouze, François Kleinclauss, et al.. Epidemiology and risk factors for febrile ureteral stent-associated urinary tract infections: A prospective observational cohort study. Journal of Infection, 2023, 87 (1), pp.12-17. ⟨10.1016/j.jinf.2023.04.021⟩. ⟨hal-04235515⟩
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- A. Baraquin, L. Pépin, P. Floerchinger, Q. Lepiller, J.-L. Prétet. Nouvelles recommandations pour le dépistage du cancer du col de l’utérus en France. Annales Pharmaceutiques Françaises, 2023, 81 (2), pp.202-209. ⟨10.1016/j.pharma.2022.09.006⟩. ⟨hal-04602309⟩
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- Denise Battaglini, Nicole White, Lavienraj Premraj, Barbara Wanjiru Citarella, Laura Merson, et al.. Long-term neurological symptoms after acute COVID-19 illness requiring hospitalization in adult patients: insights from the ISARIC-COVID-19 follow-up study. Journal of Neurology, 2023, 271 (1), pp.79-86. ⟨10.1007/s00415-023-12133-y⟩. ⟨hal-04399136⟩
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- Pauline Bellot, François Brischoux, Hélène Budzinski, Sophie Dupont, Clémentine Fritsch, et al.. Chronic exposure to tebuconazole alters thyroid hormones and plumage quality in house sparrows (Passer domesticus). Environmental Science and Pollution Research, 2023, ⟨10.1007/s11356-023-28259-5⟩. ⟨hal-04145278⟩
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- Mathieu Blot, Abdeljalil Zeggay, Ludwig Serge Aho Glélé, Caroline Laborde, Vincent Le-Moing, et al.. Is blood lymphocyte count a prognostic biomarker in Staphylococcus aureus bacteremia?. Journal of Investigative Medicine, 2023, 70 (7), pp.1549-1552. ⟨10.1136/jim-2022-002356⟩. ⟨hal-04529756⟩
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- Louis Bohard, Séverine Lallemand, Romain Borne, Sandra Courquet, Solange Bresson-Hadni, et al.. Complete mitochondrial exploration of Echinococcus multilocularis from French alveolar echinococcosis patients. International Journal for Parasitology, 2023, ⟨10.1016/j.ijpara.2023.03.006⟩. ⟨hal-04095841⟩
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- A Brun, M Greusard, Jm Reynes, M Grenier, J Bamoulid, et al.. Description of an outbreak of hemorrhagic fever with renal syndrome in the southern Jura Mountains, France, in 2021. Infectious Diseases Now, 2023, 53 (4), pp.104639. ⟨10.1016/j.idnow.2022.12.004⟩. ⟨hal-04082359⟩
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- Adrien Caillet, Anne-Pauline Bellanger, Jean Christophe Navellou, Etienne Daguindau, Steffi Rocchi, et al.. Refractory invasive pulmonary aspergillosis due to Aspergillus flavus detected with the combination of two in-house Aspergillus qPCR. Journal of Medical Mycology = Journal de Mycologie Médicale, 2023, 33 (1), pp.101350. ⟨10.1016/j.mycmed.2022.101350⟩. ⟨hal-04212333⟩
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- Félix Camirand-Lemyre, Laura Merson, Bharath Kumar Tirupakuzhi Vijayaraghavan, Aidan Burrell, Barbara Wanjiru Citarella, et al.. Implementation of Recommendations on the Use of Corticosteroids in Severe COVID-19. JAMA Network Open, 2023, 6 (12), pp.e2346502. ⟨10.1001/jamanetworkopen.2023.46502⟩. ⟨hal-04372873⟩
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- Magali Casanova, Hamza Olleik, Slim Hdiouech, Clarisse Roblin, Jean-François Cavalier, et al.. Evaluation of the Efficiency of Random and Diblock Methacrylate-Based Amphiphilic Cationic Polymers against Major Bacterial Pathogens Associated with Cystic Fibrosis. Antibiotics, 2023, 12 (1), pp.120. ⟨10.3390/antibiotics12010120⟩. ⟨hal-03998029⟩
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- C. Couchoud, X. Bertrand, M. Bourgeon, G. Piton, B. Valot, et al.. Genome-based typing reveals rare events of patient contamination with Pseudomonas aeruginosa from other patients and sink traps in a medical intensive care unit. Journal of Hospital Infection, 2023, 134, pp.63-70. ⟨10.1016/j.jhin.2023.01.010⟩. ⟨hal-04157658⟩
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- Lise Cuzin, Philippe Flandre, Clotilde Allavena, Romain Palich, Claudine Duvivier, et al.. Low-level viral loads and virological failure in the integrase strand transfer era. Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 2023, 78, pp.1111-1116. ⟨10.1093/jac/dkad056⟩. ⟨hal-04028835⟩
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- Aline Reis de Carvalho, Olivier Mathieu, Mathieu Thevenot, Philippe Amiotte-Suchet, Xavier Bertrand, et al.. Determination of Polystyrene Microplastic in Soil by Pyrolysis – Gas Chromatography – Mass Spectrometry (pyr-GC-MS). Analytical Letters, 2023, pp.1-19. ⟨10.1080/00032719.2023.2262633⟩. ⟨hal-04253854⟩
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- Jean-François Delfraissy, Mary Horgan, Kåre Mølbak, Fernando Soria Simón, Tanja Stadler, et al.. Scientific advisory councils in the COVID-19 response. The Lancet, 2023, ⟨10.1016/S0140-6736(23)01846-9⟩. ⟨hal-04370254⟩
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- Quentin Devalloir, Clémentine Fritsch, Yara Alchammas, Francis Raoul, Vincent Driget, et al.. Environmental pollution and nutritional quality modulate immune response of the wood mouse (Apodemus sylvaticus) through hormonal disturbances. Environmental Pollution, 2023, 337, pp.122100. ⟨10.1016/j.envpol.2023.122100⟩. ⟨hal-04283376⟩
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- Maxime Durand, Alicia Chateau, Justine Jubréaux, Jérôme Devy, Héna Paquot, et al.. Radiosensitization with Gadolinium Chelate-Coated Gold Nanoparticles Prevents Aggressiveness and Invasiveness in Glioblastoma. International Journal of Nanomedicine, 2023, 18, pp.243-261. ⟨10.2147/IJN.S375918⟩. ⟨hal-03957559⟩
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- Audrey Emery, Didier Hocquet, Richard Bonnet, Xavier Bertrand. Genotypic Characteristics and Antimicrobial Resistance of Escherichia coli ST141 Clonal Group. Antibiotics, 2023, 12 (2), pp.382. ⟨10.3390/antibiotics12020382⟩. ⟨hal-04157615⟩
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- Pierre Fillatre, Alexandra Mailles, Jean Paul Stahl, Pierre Tattevin, Sophie Abgrall, et al.. Characteristics, management, and outcomes of patients with infectious encephalitis requiring intensive care: A prospective multicentre observational study. Journal of Critical Care, 2023, 77, pp.154300. ⟨10.1016/j.jcrc.2023.154300⟩. ⟨hal-04335780⟩
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- Damien Fournier, Pauline Triponney, Loreen Gabriel, Patrick Plésiat, Katy Jeannot, et al.. Evaluation of 5 rapid colorimetric and immunochromatographic tests for the detection of carbapenemases in Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter spp. isolates. European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2023, 42 (8), pp.1043-1045. ⟨10.1007/s10096-023-04631-8⟩. ⟨hal-04225777⟩
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- Susie Gaillot, Saoussen Oueslati, Jean-Baptiste Vuillemenot, Maxime Bour, Bogdan Iorga, et al.. Genomic characterization of an NDM-9-producing $Acinetobacter\ baumannii$ clinical isolate and role of Glu152Lys substitution in the enhanced cefiderocol hydrolysis of NDM-9. Frontiers in Microbiology, 2023, 14, pp.1253160. ⟨10.3389/fmicb.2023.1253160⟩. ⟨hal-04204833⟩
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- Jade Ghosn, Delphine Bachelet, Marine Livrozet, Minerva Cervantes-Gonzalez, Julien Poissy, et al.. Prevalence of Post-Acute COVID-19 Symptoms Twelve Months after Hospitalisation in Participants Retained in Follow-up: Analyses Stratified by Gender from a Large Prospective Cohort. Clinical Microbiology and Infection, 2023, 29 (2), pp.254.e7-254.e13. ⟨10.1016/j.cmi.2022.08.028⟩. ⟨hal-03801797⟩
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- Patrick Giraudoux. One Health (Une seule santé): concept nouveau en maturation ou vieille histoire?. Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France, 2023, eprint, ⟨10.3406/bavf.2023.71063⟩. ⟨hal-04362767⟩
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- Patrick Giraudoux. De « nuisible » à « Espèce susceptible d’occasionner des dégâts » : un changement de terminologie qui doit faire évoluer les pratiques. Bourgogne-Franche-Comté Nature, 2023, 37-38, pp.109-113. ⟨hal-04365757⟩
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- Patrick Giraudoux, Didier Boussarie. Vivre avec la faune sauvage : pour une prise en compte rénovée de la notion de « populations animales ou individus susceptibles d’occasionner des dommages (PAISOD) ». Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France, 2023, eprint, ⟨10.3406/bavf.2023.71046⟩. ⟨hal-04362773⟩
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- Jean-Luc Prétet, Véronique Dalstein, Antoine Touzé, Agnès Beby-Defaux, Patrick Soussan, et al.. High levels of HPV16-L1 antibody but not HPV16 DNA load or integration predict oropharyngeal patient outcome: The Papillophar study. Clinical and Experimental Medicine, 2023, 23 (1), pp.87-96. ⟨10.1007/s10238-022-00796-2⟩. ⟨hal-03603889⟩
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- Mathieu Schwartz, Valentin Boichot, Mariam Muradova, Pablo Fournier, Patrick Senet, et al.. Structure–activity analysis suggests an olfactory function for the unique antennal delta glutathione transferase of Apis mellifera. FEBS Letters, 2023, 597 (24), pp.3038-3048. ⟨10.1002/1873-3468.14770⟩. ⟨hal-04329230⟩
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- Hugo Sentenac, Adeline Loyau, Luca Zoccarato, Vincent Jassey, Hans-Peter Grossart, et al.. Biofilm community composition is changing in remote mountain lakes with a relative increase in potentially toxigenic algae. Water Research, 2023, 245, pp.120547. ⟨10.1016/j.watres.2023.120547⟩. ⟨hal-04210814⟩
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- Rémi Nguyen Van, Sarah Tubiana, Thomas de Broucker, Joseph Cédric, Carine Roy, et al.. Persistent headaches one year after bacterial meningitis: prevalence, determinants and impact on quality of life. European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2023, 42 (12), pp.1459-1467. ⟨10.1007/s10096-023-04673-y⟩. ⟨hal-04264335⟩
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- Delphine Vergoz, Flore Nilly, Florie Desriac, Magalie Barreau, Antoine Géry, et al.. 6-Polyaminosteroid Squalamine Analogues Display Antibacterial Activity against Resistant Pathogens. International Journal of Molecular Sciences, 2023, 24 (10), pp.8568. ⟨10.3390/ijms24108568⟩. ⟨hal-04161494⟩
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- Manuelle Viguier, Corine Pérals, Béatrice Poirier, Maxime Battistella, François Aubin, et al.. Human papilloma virus‐16‐specific CD8+ T‐cell expansions characterize different clinical forms of lichen planus and not lichen sclerosus et atrophicus. Experimental Dermatology, 2023, 32 (6), pp.859-868. ⟨10.1111/exd.14788⟩. ⟨hal-04075439⟩
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- Xavier Vuillemin, Maëlle da Silva, Maxime Bour, Céline Landon, Patrick Plésiat, et al.. Cefiderocol activity is compromised by acquired extended-spectrum oxacillinases in Pseudomonas aeruginosa. International Journal of Antimicrobial Agents, 2023, 62 (3), pp.106917. ⟨10.1016/j.ijantimicag.2023.106917⟩. ⟨hal-04225762⟩
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- Marina Wainstein, Nicholas Spyrison, Danyang Dai, Moji Ghadimi, Jonathan Chávez-Iñiguez, et al.. Association of Country Income Level With the Characteristics and Outcomes of Critically Ill Patients Hospitalized With Acute Kidney Injury and COVID-19. Kidney International Reports, 2023, 8 (8), pp.1514-1530. ⟨10.1016/j.ekir.2023.05.015⟩. ⟨hal-04338529⟩
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- Abdeljallil Zeggay, Alban Atchon, Benoit Valot, Didier Hocquet, Xavier Bertrand, et al.. Genome Analysis of Methicillin-Resistant and Methicillin-Susceptible Staphylococcus aureus ST398 Strains Isolated from Patients with Invasive Infection. Microorganisms, 2023, 11 (6), pp.1446. ⟨10.3390/microorganisms11061446⟩. ⟨hal-04157672⟩
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Communication dans un congrès
2024
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- Patrick Giraudoux. Une seule santé (One Health). Lancement du PRSE4 Auvergne Rhône Alpes, ARS Auvergne Rhône Alpes, Mar 2024, Marcy L'étoile, France. ⟨hal-04493333⟩
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- Patrick Giraudoux. Une seule santé (One Health): concept nouveau en maturation ou vieille histoire?. Webinaire, Société française de parasitologie, Jun 2024, Webinaire, France. ⟨hal-04613393⟩
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- Patrick Giraudoux. Une seule santé (One Health). One health (ou "Une seule santé"), Graine et Promotion de la santé en Nouvelle Aquitaine, Feb 2024, Webinaire, France. ⟨hal-04464450⟩
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- Patrick Giraudoux. One health, biodiversity, conservation and wildlife tourism: what's at stake?. Café des sciences de l'Institut Français, Consulat français de Chengdu, Mar 2024, Chengdu, China. ⟨hal-04510814⟩
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- Patrick Giraudoux. Les temps du vivant: quel avenir pour la biodiversité ?. La ville du changement, Fondation Good Planet, Jun 2024, Lons-le-Saunier (39), France. ⟨hal-04613392⟩
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- Patrick Giraudoux. Conservation du Rhinopithèque de Biet et écotourisme : quels enjeux ?. Missions de conservation dans le monde. Rien n’est joué, Académie vétérinaire de France, Jun 2024, Paris, France. ⟨hal-04613388⟩
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- Patrick Giraudoux. Biodiversité. Programme de formation à la transition écologique des cadres de l’Etat, CNRS, Mar 2024, Dijon, France. ⟨hal-04614186⟩
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- Patrick Giraudoux. One Health (une seule santé): atelier débat. Cycle Supérieur de la Transition, Centre national de la fonction publique territoriale et l’Institut national des études territoriales, May 2024, Besançon (Doubs), France. ⟨hal-04577182⟩
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- Patrick Giraudoux. Une seule santé (One Health): concept nouveau en maturation ou vieille histoire?. Colloque international One Health. L'approche One Health pour innover dans la lutte contre les maladies infectieuses: des slogans aux actions, Université de Kinshasa - INOHA, May 2024, Kinshasa, Congo - Kinshasa. ⟨hal-04614214⟩
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2023
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- Eline Dubois, Susie Gaillot, Patrick Plésiat, Catherine Llanes. Résistance et hypersensibilité aux antibiotiques de mutants de Pseudomonas aeruginosa sélectionnés par le cinnamaldéhyde : partie 2. Réunion annuelle du GDR CNRS Pseudomonas, Alsace, Oct 2023, Mittelwhir, France. ⟨hal-04269737⟩
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- Patrick Giraudoux. Chasse et écologie. Séminaire "La chasse au coeur des territoires", Groupama Paris Val de Loire et Terrassure, Mar 2023, Chambord, France. ⟨hal-04082079⟩
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- Patrick Giraudoux. One Health (une seule santé) : concept nouveau en maturation ou vieille histoire ?. Séminaire de l'UMR 1184, IDMIT Department Université Paris-Saclay, Inserm, CEA, UMR 1184, IDMIT Department Université Paris-Saclay, Inserm, CEA, Jun 2023, Frémigny, France. ⟨hal-04117632⟩
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- Patrick Giraudoux. One Health (une seule santé) : concept nouveau en maturation ou vieille histoire ?. P'tit déjeuner Santé Environnement, Pôle fédératif de recherche et formation en santé publique BFC, Feb 2023, Besançon, France. ⟨hal-03970558⟩
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- Patrick Giraudoux. Santé des écosystèmes : quelle définition ?. Conférences One Health & Santé Globale, Fondation-Hôpital Foch; Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines, Nov 2023, Versaille- Saint-Quentin en Yvelines (Virtual conference), France. ⟨hal-04362722⟩
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- Patrick Giraudoux. Échinococcoses et une seule santé: un exemple d’ approache nécessairement indisciplinée. Master d'éco-épidémiologie, Université de Montpellier, Sep 2023, Montpellier ( Virtual Conference ), France. ⟨hal-04362715⟩
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- Patrick Giraudoux. One Health and biodiversity: what’s the link ?. Conference at Xishuangbanna National Nature Reserve, Xishuangbanna National Nature Reserve, Dec 2023, Jinghong, China. ⟨hal-04362727⟩
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- Patrick Giraudoux. Rodent pest management in multifactorial socio-ecosystems: a practical application to the Jura massif. 17th Rodent and Spatium, University of Valladolid, May 2023, Valladolid, Spain. ⟨hal-04093326⟩
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- Patrick Giraudoux. One Health and biodiversity: what’s the link ?. Conference at Leshan Normal University, Dec 2023, Leshan, China. ⟨hal-04362724⟩
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- Patrick Giraudoux. Une seule santé et santé des écosystèmes. Quelles définitions ?. Master d'écologie des maladies infectieuses, SECMI, Dec 2023, Kinshasa (virtual conference), Congo - Kinshasa. ⟨hal-04362723⟩
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- Patrick Giraudoux. La biodiversité. Cinquantenaire du Parc des Écrins, Nov 2023, Gap (virtual conference), France. ⟨hal-04362720⟩
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- Patrick Giraudoux. Santé des écosystèmes et une seule santé : la biodiversité, à quoi ça sert ?. Conférences de l'Université Ouverte, Université de Franche-Comté, Dec 2023, Lure, France. ⟨hal-04362742⟩
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- Patrick Giraudoux. De la santé environnement au concept "Une Seule Santé". 26è Journée Nationale d’Étude « Élus Santé Publique et Territoires », Association nationale des villes pour le développement de la santé publique, Jun 2023, Paris, France. ⟨hal-04117711⟩
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- Patrick Giraudoux. One Health (une seule santé) : concept nouveau en maturation ou vieille histoire ?. Médecine et Santé un lien évident ?, Les Rencontres Georges Canguilhem Santé-Société; Euro Cos, Humanisme & Santé, Oct 2023, Strasbourg, France. ⟨hal-04098021⟩
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- Patrick Giraudoux. Atelier participatif: prévention et lutte contre les maladies zoonotiques et vectorielles. Atelier Mettre en œuvre une seule santé au sein des administrations régionales, Commissariat général au développement durable; Humanité et Biodiversité, Jun 2023, Paris, France. ⟨hal-04362746⟩
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- Patrick Giraudoux. Une seule santé (One Health), quesaco ?. Conférence régionale de santé et de l’autonomie, IREPS Bourgogne Franche-Comté, Apr 2023, Dijon, France. ⟨hal-04082119⟩
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- Patrick Giraudoux. Pourquoi de nouvelles maladies émergent ? En quoi la biodiversité est-elle importante ?. Festival du climat, Municipalité de Pirey, May 2023, Pirey, France. ⟨hal-04096992⟩
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- Patrick Giraudoux. Une seule santé (One Health): quesaco ?. Assemblée générale ARS Bourgogne Franche-Comté, ARS Bourgogne Franche-Comté, Jun 2023, Dijon, France. ⟨hal-04117692⟩
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- Patrick Giraudoux, Thierry Lefrancois. Entre COVARS et Une Seule Santé : veille et anticipation des risques sanitaires. Séance du président: entre CoVARS et Une seule santé (One Health), veille et anticipation des risques sanitaires, Académie vétérinaire de France, Dec 2023, Paris, France. ⟨hal-04362738⟩
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- Patrick Giraudoux. Biodiversity, what’s all the fuss ?. Séminaires du Master Conservation de la biodiversité, Université de Neuchâtel, Nov 2023, Neuchâtel, Switzerland. ⟨hal-04362735⟩
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- Patrick Giraudoux. Le CoVARS: quesaco ?. Webinaire sur la vaccination, CPTS CaPaciTéS Besançon & Métropole, Oct 2023, Besançon ( Conférence virtuelle ), France. ⟨hal-04362718⟩
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- Patrick Giraudoux. Une seule santé (One Health) : quésaco ?. Conférences de la SHND, Société d'Histoire naturelle du Doubs, Dec 2023, Besançon, France. ⟨hal-04362739⟩
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- Patrick Giraudoux. Biodiversité. Convention citoyenne pour le climat et la biodiversité, Conseil régional de Bourgogne Franche-Comté, Nov 2023, Besancon, France. ⟨hal-04362731⟩
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- C Pelosi, C Bertrand, B Appenzeller, M Coeurdassier, G Daniele, et al.. In natura exposure of soil, earthworms and small mammals to pesticides in agricultural landscapes: from fears to fact. SETAC Europe 33rd annual meeting, Apr 2023, Dublin (IE), Ireland. pp.1. ⟨hal-04253559⟩
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Chapitre d'ouvrage
2024
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- Rica Joy Flor, Patrick Giraudoux, Grant Singleton. Chapter 8: Integration of sociological approaches in rodent management: historical perspectives. Rodent Pests: Ecology and Management, CABI, In press. ⟨hal-04572541⟩
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- Patrick Giraudoux. Le commun du vivant. Sarah Carvallo; Arnaud Macé. L'humain et le végétal. Processus et formes de vie partagés, Presses Universitaires de Franche-Comté, pp.195-216, 2024, Sciences: concepts et problèmes, 978-2-84867-105-5. ⟨hal-04632956⟩
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2023
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- Bruno Andreotti, Aliénor Bertrand, Arnaud Macé, Patrick Giraudoux. Virus en aérosol, savoir en urgence. Les temps des pandémies, Belin Education, 2023. ⟨hal-04385387⟩
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- Cabrioles Autodéfense Sanitaire, Aliénor Bertrand, Arnaud Macé, Patrick Giraudoux. L’autodéfense sanitaire. Les temps des pandémies, 2023. ⟨hal-04385439⟩
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- Jean-Paul Gonzalez, Maximilien Debia, Marc Dufumier, Patrick Giraudoux, André Fougeroux, et al.. Une seule santé. Isabelle Goupil-Somany; Maximilien Debia; Philippe Glorennec; Jean-Paul Gonzalez; Nolwen Noisel. Environnement et santé publique. Fondements et pratiques., Presses de l'EHESP, pp.89-112, 2023, 978-2-8109-1007-6. ⟨hal-04132196⟩
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- Jean-François Guégan, Patrick Giraudoux. Aiôn et Khronos dans la tourmente de la crise pandémique à COVID-19. Alienor Bertrand; Patrick Giraudoux; Arnaud Macé. Les temps des pandémies, Belin education, 2023, 979-1035823917. ⟨hal-04082351⟩
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- Alexandre Tetard, Sarah Foley, Gaetan L. A. Mislin, Jean Michel Brunel, Estefania Oliva, et al.. Negative impact of citral on susceptibility of Pseudomonas aeruginosa to antibiotics.. Prime Archives in Microbiology: 3rd Edition; 2023, Aalaa Mahgoub Albasha, In press. ⟨hal-04269786⟩
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Ouvrages
2023
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- Aliénor Bertrand, Patrick Giraudoux, Arnaud Macé. Les temps des pandémies. Belin, 2023, L'écologie. Pour un parlement des savoirs, 979-10-358-2391-7. ⟨hal-04382212⟩
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Poster de conférence
2024
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- Eline Dubois, Patrick Plésiat, Catherine Llanes. Involvement of AmgRS in the induction of Pseudomonas aeruginosa MexAB-OprM pump by cinnamon essential oil. International biennial Pseudomonas conference XIX edition, Sep 2024, Copenaghen, Denmark. ⟨hal-04756968⟩
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- Edward Topp, Laura Alvarez-Fraga, Pierre Benoit, Marjolaine Bourdat-Deschamps, Alain Hartmann, et al.. What risk does crop irrigation with reclaimed municipal wastewater represent with respect to the transmission of antimicrobial resistance to humans?. Environmental Dimension of Antimicrobial Resistance 7, May 2024, Montreal, Canada. ⟨hal-04684163v2⟩
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Rapport
2023
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- Emmanuelle Gilot-Fromont, Isabelle Villena, Elsa Bonnaud, Claude Fischer, Etienne Giraud, et al.. Évaluation des impacts sur la santé publique de la dynamique des populations de renards. Saisine n°2022-SA-0049, Anses. 2023, 200 p. ⟨anses-04171242⟩
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- Eric Oswald, Xavier Bertrand, Catherine Chubilleau, Lucie Collineau, Mélanie Colomb-Cotinat, et al.. Élaboration d’une liste de couples « bactérie/famille d’antibiotiques » d’intérêt prioritaire dans le contrôle de la diffusion de l’antibiorésistance de l’animal aux humains et propositions de mesures techniques en appui au gestionnaire. Saisine n°2020-SA-0066, Anses. 2023, 192 p. ⟨anses-04342509⟩
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Thèse
2023
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- Hugo Sentenac. Liens entre le parasite d'amphibiens Batrachochytrium dendrobatidis et les biofilms benthiques de lacs de montagne pyrénéens. Sciences agricoles. Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT, 2023. Français. ⟨NNT : 2023INPT0034⟩. ⟨tel-04187711⟩
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Pré-publication, Document de travail
2024
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- Baptiste Elie, Vanina Boué, Philippe Paget-Bailly, Marie-Paule Algros, Alice Baraquin, et al.. Estimating HPV16 genome copy number per infected cell in cervical smears. 2024. ⟨hal-04759550⟩
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2023
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- Florence Ader, Maude Bouscambert-Duchamp, Maya Hites, Nathan Peiffer-Smadja, Julien Poissy, et al.. Remdesivir for the treatment of hospitalised patients with COVID-19: final results from the DisCoVeRy randomised, controlled, open-label trial. 2023. ⟨hal-04117589⟩
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- Florence Ader, Nathan Peiffer-Smadja, Julien Poissy, Maude Bouscambert-Duchamp, Drifa Belhadi, et al.. Antiviral drugs in hospitalized patients with COVID-19 - the DisCoVeRy trial. 2023. ⟨hal-04118710⟩
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