Chrono-environnement - UMR 6249 CNRS/UFC
Campus de la Bouloie
16 rue de Gray
25030 Besançon cedex
France
Ève Afonso
Maîtresse de Conférences – Université de Franche-Comté
DYNABIO
eve.afonso@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr
+33 (0)3 81 66 57 91, bureau -209M (La Bouloie)
Étudiant⋅e :
0000-0001-5836-9909 
eve-afonso
Biodiversité – Chauve-souris – Génétique des populations – Écologie de la faune sauvage
Présentation
Mes recherches portent sur les impacts des changements globaux sur l’écologie de la faune sauvage.
Mon travail intègre des approches d’écologie moléculaire (notamment grâce à des techniques non invasives), de génétique des populations, de biologie de la conservation, d’écoépidémiologie et de modélisation statistique. Mes modèles biologiques incluent les mammifères, en particulier les chauves-souris et les singes.
Projets
- IRP Forêts froides – En cours depuis le : 01/11/2021 → 01/11/2026
- Epiderme – Épidémies d’insectes et régime de feux en forêt boréale. Une approche croisée paléo-écologie et ADN sédimentaire – Achevé : 01/01/2021 → 31/12/2021
- Les assemblage bactériens comme prédicteurs de la phase de déclin des populations cycliques de campagnol terrestre – Achevé : 01/10/2014 → 30/09/2019
- GDRI EHEDE – GDRI Ecosystem health and environmental disease ecology – Achevé : 01/01/2013 → 31/12/2020
- LWMH – Laboratory of Wildlife Management and Ecosystem Health – En cours depuis le : 01/01/2012
Publications
Article dans une revue
2024
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- Patrick Giraudoux, Ève Afonso, Céline Clauzel, Cécile Callou, Li Li. Conservation du Rhinopithèque de Biet (Rhinopithecus bieti) et tourisme animalier : quels enjeux ?. Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France, 2024, epub, pp.1-16. ⟨10.3406/bavf.024.71106⟩. ⟨hal-04757966v2⟩
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2021
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- Eve Afonso, Rong Fu, Amaël Dupaix, Anne-Claude Goydadin, Zhonghua Yu, et al.. Creating small food-habituated groups might alter genetic diversity in the endangered Yunnan snub-nosed monkey. Global Ecology and Conservation, 2021, 26, pp.e01422. ⟨10.1016/j.gecco.2020.e01422⟩. ⟨hal-03174983⟩
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- Nicolas Meyer, Loïc Bollache, Matthias Galipaud, Jérôme Moreau, François-Xavier Dechaume-Moncharmont, et al.. Behavioural responses of breeding arctic sandpipers to ground-surface temperature and primary productivity. Science of the Total Environment, 2021, 755 (2), pp.142485. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.142485⟩. ⟨hal-02986001⟩
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2020
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- Patrick Giraudoux, Aurélien Levret, Eve Afonso, Michael Coeurdassier, Geoffroy Couval. Numerical response of predators to large variations of grassland vole abundance and long‐term community changes. Ecology and Evolution, 2020, 10 (24), pp.14221-14246. ⟨10.1002/ece3.7020⟩. ⟨hal-03011763⟩
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- Patrick Giraudoux, Aurélien Levret, Eve Afonso, Michael Coeurdassier, Geoffroy Couval. Suivi à long-terme de la réponse numérique des prédateurs aux grandes variations d’abondance de campagnols prairiaux dans le Val d’Usiers, Massif du Jura. Bourgogne-Franche-Comté Nature, 2020, 32, pp.151-168. ⟨hal-04454453⟩
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- Nicolas Meyer, Loïc Bollache, François‐xavier Dechaume‐moncharmont, Jérôme Moreau, Eve Afonso, et al.. Nest attentiveness drives nest predation in arctic sandpipers. Oikos, 2020, 129 (10), pp.1481-1492. ⟨10.1111/oik.07311⟩. ⟨hal-02961741⟩
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- Petra Villette, Eve Afonso, Geoffroy Couval, Aurélien Levret, Maxime Galan, et al.. Spatio-temporal trends in richness and persistence of bacterial communities in decline-phase water vole populations. Scientific Reports, 2020, 10, pp.9506. ⟨10.1038/s41598-020-66107-5⟩. ⟨hal-02876769⟩
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2017
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- Eve Afonso, Anne-Claude Goydadin, Patrick Giraudoux, Gilles Farny. Investigating Hybridization between the Two Sibling Bat Species Myotis myotis and M. blythii from Guano in a Natural Mixed Maternity Colony.. PLoS ONE, 2017, 12 (2), pp.e0170534. ⟨hal-01492347⟩
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- Jenny Knapp, Sylvie Damy, Jonathan Brillaud, Jean-Daniel Tissot, Jérémy Navion, et al.. EWET: Data collection and interface for the genetic analysis of Echinococcus multilocularis based on EmsB microsatellite. PLoS ONE, 2017, 12 (10), pp.e0183849. ⟨10.1371/journal.pone.0183849⟩. ⟨hal-01667697⟩
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2016
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- Eve Afonso, Pierline Tournant, Jean-Christophe Foltête, Patrick Giraudoux, Pierre-Emmanuel Baurand, et al.. Is the lesser horseshoe bat (Rhinolophus hipposideros) exposed to causes that may have contributed to its decline? A non-invasive approach. Global Ecology and Conservation, 2016, 8, pp.123-137. ⟨10.1016/j.gecco.2016.09.002⟩. ⟨hal-01368326⟩
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2015
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- E Afonso, J Knapp, N Tête, G Umhang, D Rieffel, et al.. Echinococcus multilocularis in Kyrgyzstan: similarity in the Asian EmsB genotypic profiles from village populations of Eastern mole voles (Ellobius tancrei) and dogs in the Alay valley.. Journal of Helminthology, 2015, pp.1-7. ⟨hal-01175795⟩
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2010
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- Eve Afonso, P. Thulliez, Emmanuelle Gilot-Fromont. Local meteorological conditions, dynamics of seroconversion to Toxoplasma gondii in cats ( Felis catus) and oocyst burden in a rural environment.. Epidemiology and Infection, 2010, 138, pp.1105-1113. ⟨10.1017/S0950268809991270⟩. ⟨hal-00443531⟩
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2007
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- Eve Afonso, M.-L. Poulle, M. Lemoine, I. Villena, D. Aubert, et al.. Prevalence of Toxoplasma Gondii in small mammals from the ardennes region France. Folia Parasitologica, 2007, 54, pp.313-314. ⟨hal-00434741⟩
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2006
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- Eve Afonso, P. Thulliez, Emmanuelle Gilot-Fromont. Transmission of Toxoplasma gondii in an urban population of domestic cats (Felis catus). International Journal for Parasitology, 2006, 36, pp.1373-1382. ⟨hal-00428041⟩
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Communication dans un congrès
2018
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- Petra Villette, Eve Afonso, Geoffroy Couval, Aurélien Levret, Jean-François Cosson, et al.. Bacterial Parasite Communities of the Fossorial Water Vole Arvicola terrestris During a Period of High Abundance: Richness and Similarity in a Dynamic World. Rodents 2018: 6th International Conference of Rodent Biology and Management & 16th Rodens et Spatium, Sep 2018, Potsdam, Germany. ⟨hal-01870903⟩
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2017
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- Patrick Giraudoux, Eve Afonso, Jenny Knapp, Wangzhong Jia, Hongbin Yan, et al.. 27 year monitoring of an alveolar echinococcosis hotspot in south-Gansu. XXVII World Congress of Echinococcosis, Oct 2017, Algiers, Algeria. ⟨hal-01614425⟩
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2016
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- Eve Afonso, Renaud Scheifler, Jean-Christophe Foltête, A.-C. Goydadin, Li Li, et al.. Non-invasive genetic tools to study wildlife populations. Research and methods in ecohealth and conservation, GDRI Ecosystem Health and Environmental Disease Ecology, Nov 2016, Kunming, China. ⟨hal-01367363⟩
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- Patrick Giraudoux, Eve Afonso, Jenny Knapp, Wangzhong Jia, Hongbin Yan, et al.. 27 year monitoring of an alveolar echinococcosis hotspot in south-Gansu. Research and methods in ecohealth and conservation, GDRI Ecosystem Health and Environmental Disease Ecology, Nov 2016, Kunming, China. ⟨hal-01363734⟩
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- Francis Raoul, Antoine Perasso, Virgile Baudrot, Benoit Valot, Eve Afonso, et al.. New approaches to description and modeling of trophic interactions: reliable allies to study trophically-transmitted parasites?. Research and methods in ecohealth and conservation, GDRI Ecosystem Health and Environmental Disease Ecology, Nov 2016, Kunming, China. ⟨hal-01367367⟩
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2012
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- Patrick Giraudoux, F. Raoul, Eve Afonso, Iskender Ziadinov, Yurong Yang, et al.. Spatial approach of Echinococcus multilocularis transmission ecology in continental Asia. International Symposium for Cestode Zoonosis Control, Oct 2012, Shanghai, China. ⟨hal-00724870⟩
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2011
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- Pierline Tournant, Eve Afonso, Sébastien Roué, Patrick Giraudoux, Jean-Christophe Foltête. Assessing habitat connectivity of the lesser horseshoe bat using graph theory to explain its distribution. VIth European Congress of Mammalogy, Jul 2011, Paris, France. ⟨hal-00610755⟩
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Chapitre d'ouvrage
2022
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- Eve Afonso, Cécile Callou, Céline Clauzel, Patrick Giraudoux, Li Li. Conservation du Rhinopithèque de Biet. Patrick Giraudoux. Socio-écosystèmes. L'indiscipline comme exigence du terrain, ISTE éditions, pp.225-258, 2022, 9781789480528. ⟨hal-03512103⟩
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2013
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- Jean-Christophe Foltête, Xavier Girardet, Céline Clauzel, Pierline Tournant, Gilles Vuidel, et al.. Estimer l'impact des grandes infrastructures de transport sur la distribution des espèces : proposition et test d'un protocole méthodologique. Luginbühl Yves. Infrastructures de transport terrestres, écosystèmes et paysages, des liaisons dangereuses, La documentation française, pp.201-218, 2013. ⟨hal-00875870⟩
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2012
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- Emmanuelle Gilot-Fromont, Maud Lélu, Marie-Laure Dardé, Céline Richomme, D. Aubert, et al.. The Life Cycle of Toxoplasma gondii in the Natural Environment. Olgica Djurković Djaković. Toxoplasmosis - Recent Advances, InTech, pp.3-36, 2012, 978-953-51-0746-0. ⟨10.5772/48233⟩. ⟨hal-00820888⟩
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Poster de conférence
2016
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- P. Villette, Eve Afonso, G Couval, A Levret, M. Galan, et al.. Metabarcoding of Bacterial Pathogens in a Rodent Pest: Which Organ?. SMBE 2016: Society for Molecular Biology and Evolution Annual Meeting, Jul 2016, Gold Coast, Queensland, Australia. ⟨hal-01870929⟩
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Rapport
2015
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- Jean-Christophe Foltête, Eve Afonso, Céline Clauzel, Xavier Girardet, Patrick Giraudoux, et al.. Graphab 2. [Rapport de recherche] ThéMA, UMR 6049; Chrono-Environnement, UMR 6249; MSHE Ledoux, USR 3124. 2015, 96 p. ⟨hal-03106236⟩
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2011
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- Jean-Christophe Foltête, Eve Afonso, Céline Clauzel, Xavier Girardet, Patrick Giraudoux, et al.. Graphab. [Rapport de recherche] N° 0001653 – 10/2008, MSHE Ledoux, USR 3124; ThéMA, UMR 6049; Chrono-Environnement, UMR 6249. 2011, 62 p. ⟨hal-03105989⟩
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Thèse
2007
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- Eve Afonso. ETUDE DE LA DYNAMIQUE DE LA TRANSMISSION DE TOXOPLASMA GONDII DANS DES MILIEUX CONTRASTES. Ecologie, Environnement. Université de Reims - Champagne Ardenne, 2007. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-00371738⟩
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