Biosurveillance
Plateforme technologique d’étude des Environnements Anciens et Actuels (PEA²t)
Biosurveillance de la qualité de l’environnement
Type d’échantillons : Sol Plantes Invertébré Micromammifère Air
L’utilisation d’organisme modèle in situ ou en condition contrôlée permet d’évaluer la part biodisponible des polluants et d’estimer les risques sur le vivant.
- Culture et élevage en laboratoire en conditions contrôlées : Interactions substances chimiques, sol, faune du sol.
- Bioindications actives (encagement d’organismes issus d’élevage de laboratoire) et passive (prélèvement d’organismes autochtones) en conditions réelles in situ.
- Évaluation de l’impact de substances sur le vivant.
- Évaluation des risques environnementaux et sanitaires : définition de valeurs seuils, d’indices et de classes de risques.
- Qualification de pollutions passées et présentes (anomalies de composition).
- Métrologie des polluants atmosphériques (particules, aérosols, ozone, NO2).
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Domaines d’expertise
Monitoring in situ et expérimentation en conditions contrôlées
Instrumentation et biosurveillance in situ pour le suivi long terme des milieux naturels dans le cadre des SNO et zones ateliers ; dispositifs de culture et d’élevage en enceinte climatique.
Caractérisations chimiques de matrices environnementales complexes
Identification qualitative et quantitative des composés organiques et inorganiques dans de multiples matrices environnementales
Isolation et caractérisation de l’ADN environnemental
Mise en œuvre de techniques de biologie moléculaire telles que la PCR quantitative, ou la métagénomique pour l’analyse de l’ADN issu d’échantillons environnementaux.
Exemples d’application
Rencontre avec Léa Bariod, écotoxicologue de la faune sauvage
Actuellement post-doctorante investie sur les projets SPACEMOD et COMICS consacrés aux effets des multi-contaminations (pesticides, éléments traces métalliques) sur les réseaux trophiques et la santé des micromammifères.
SPACEMOD
À l’heure actuelle il n’existe plus en France, voire plus largement, de logiciel générique d’évaluation du risque sur les écosystèmes (ERE) pour les sites et sols pollués (SSP). Le projet SPACEMOD vise à développer un outil spatialement explicite de modélisation des transferts et des impacts des mélanges de contaminants chimiques dans les réseaux trophiques terrestres destiné à l’ERE et la réhabilitation des SSP (et plus généralement de tout type de site contaminé par des substances chimiques).
COMICS
Le projet COMICS vise donc à comprendre comment la co-exposition à des contaminants, pesticides et métaux, influencent l’état de santé et le microbiote digestif chez la faune sauvage en étudiant des petits mammifères en milieu naturel. Cette étude est basée sur une approche interdisciplinaire réunissant des partenaires spécialisés dans les domaines de l’écologie et l’écotoxicologie, la chimie analytique et la chimie environnementale, la biologie moléculaire, la génomique et la microbiologie.
Principaux équipements sollicités
Personnels impliqués
Gudrun Bornette, Directrice de Recherche – CNRS, SOPASTgudrun.bornette@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr
Michael Coeurdassier, Maître de Conférences – UMLP, POLLUTIONmichael.coeurdassier@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 81 66 57 41, bureau -110L (La Bouloie)
Etienne Godard, Adjoint Administratif, ADMINISTRATION, PEA²tetienne.godard@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, bureau -215K (La Bouloie)
Didier Hocquet, Professeur – UMLP, PATHOGENESdhocquet@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 70 63 21 34, bureau R212 (HdC)
Francis Raoul, Professeur – UMLP, DYNABIO, PATHOGENES, POLLUTIONfrancis.raoul@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 81 66 57 36, bureau -114L (La Bouloie)