Site Hauts du Chazal
UMR 6249 Chrono-environnement
19 rue Ambroise Paré
25030 Besançon cedex
France
0009-0006-9113-1381 
ruben-ladeira
Bioinformatics – Metagenomics – Data mining – Microbiome
Présentation
Après un stage en bioinformatique appliquée à la microbiologie chez Danone Research & Innovation, sous la direction de Julien Tap et Muriel Derrien, j’ai intégré le Centre Hospitalier Universitaire de Besançon en tant qu’ingénieur de recherche. Mon activité se concentre sur l’analyse de données de séquençage issues de tumeurs et de microbiotes humains. En collaboration étroite avec le service d’hépatologie, je participe à une étude clinique sur le microbiote intestinal chez des patients atteints de cirrhose sévère. Parallèlement, je suis doctorant affilié au laboratoire CNRS-UFC Chrono-environnement, où ma thèse porte sur l’étude des microbiotes humains et leur association avec la santé.
Thèse débutée en novembre 2024 sous la direction de Benoit Valot et la co-direction de Didier Hocquet.
Sujet : Étude des microbiomes en association avec la santé humaine par des approches métagénomiques et biostatistiques
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Publications
Article dans une revue
2023
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- Ruben Ladeira, Julien Tap, Muriel Derrien. Exploring Bifidobacterium species community and functional variations with human gut microbiome structure and health beyond infancy. Microbiome Research Reports, 2023, 2 (2), pp.9. ⟨10.20517/mrr.2023.01⟩. ⟨hal-04059096⟩
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- Mathieu Schwartz, Valentin Boichot, Mariam Muradova, Pablo Fournier, Patrick Senet, et al.. Structure–activity analysis suggests an olfactory function for the unique antennal delta glutathione transferase of Apis mellifera. FEBS Letters, 2023, 597 (24), pp.3038-3048. ⟨10.1002/1873-3468.14770⟩. ⟨hal-04329230⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
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