ÉPIDORÉ
Projet ÉPIDORÉ
Épidémiologie de Staphylococcus aureus CC398 : de l’animal à l’homme
Le projet EPIDORÉ vise à étudier la prévalence et l’origine génétique des souches de Staphylococcus aureus appartenant au complexe clonal 398 et résistantes à la méticilline, isolées chez l’homme et chez les animaux (porcs, volailles, bovins).
Prélèvement d’un élevage porcin de Franche-Comté ©P. Cholley
Le clone Staphylococcus aureus ST398, appartenant au complexe clonal 398, a été décrit comme un agent zoonotique identifié initialement en France et aux Pays-Bas chez des éleveurs porcins au milieu des années 2000. Ces souches étaient très majoritairement résistantes à la méticilline (SAMR). Parallèlement, des souches ST398, le plus souvent sensibles à la méticilline (SAMS), ont été décrites de plus en plus fréquemment chez des personnes sans contact avec le bétail.
Les souches ST398 sont séparées en deux populations distinctes :
- une population SAMR, présentant une co-résistance à la tétracycline (probablement liée à l’utilisation d’antibiotiques dans certains élevages animaux), isolée d’infection non grave (cutanée et pulmonaire) chez des patients ayant une notion de contact rapproché avec les animaux (essentiellement les porcs),
- et une population SAMS, plus virulente que son homologue, qui est associée à la présence du prophage PhiSa3, et qui est isolée d’infections humaines graves et sans notion d’exposition à des animaux d’élevage.
Depuis 2009, une surveillance des souches de S. aureus CC398 est réalisée dans les bactériémies au CHU de Besançon. Alors que le clone SAMS CC398 est prépondérant, on note l’apparition depuis 2014 de souche SAMR CC398 de manière sporadique (environ 2 souches par an de 2014 à 2022) chez des patients sans contact avec les animaux. L’étude génétique de quatre de ces souches a montré la présence d’un SAMR associée à une résistance à la tétracycline, mais également à la présence du prophage PhiSa3 marqueur de virulence et d’adaptation à l’homme de ce clone. L’analyse phylogénétique a montré que ces quatre souches étaient très proches de souches d’origine animales de type volailles.
Les objectifs de l’étude sont d’évaluer la prévalence et l’origine génétique des souches SAMR CC398 isolés de prélèvements humains et animaux (porcs, volailles, bœufs) à différents moments de la production (élevage, viande) et d’estimer le potentiel risque de transmission de l’animal à l’homme.
Les objectifs secondaires sont d’évaluer les facteurs cliniques et démographiques associés aux infections humaines à SAMR CC398
Photographie au microscope optique de Staphylococcus aureus dans une hémoculture.
En bref
Kévin Bouiller, Professeur des universités - praticien hospitalier (PU-PH) – UMLP, CHU Besançon, PATHOGENESkevin.bouiller@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 81 21 91 87, bureau CHU Besançon
- Constance Mouget (Master 2) : mémoire intitulé Caractéristiques génétiques de Staphylococcus aureus issues de prélèvements animaux et humains
