PATHOGÈNES
Thème Agents Pathogènes
Histoire, diffusion, résistance et génomique
Les objectifs communs de ce thème sont de comprendre et d’identifier les facteurs favorisant l’émergence, la sélection et la diffusion des agents pathogènes. Les modifications de l’environnement, les interactions entre l’homme et l’animal, les contaminations par les agents sélecteurs de mutations et les transferts génétiques modifient ainsi l’histoire évolutive de ces pathogènes, à l’échelle de la population humaine, de la communauté microbienne (microbiotes) et de la cellule d’agent pathogène (single cell). La particularité de ce thème est d’avoir une approche intégrée, allant des observations (cliniques ou sur le terrain) et des caractérisations phénotypiques des agents pathogènes, jusqu’au décryptage des mécanismes moléculaires physiopathologiques à l’aide d’outils ‘omics’.
Coordinateurs du thème PATHOGENES :
Frédéric Grenouillet, Professeur des universités - praticien hospitalier (PU-PH) – UMLP, CHU Besançon, PATHOGENESfrederic.grenouillet@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, bureau CHU Besançon
Benoit Valot, Ingénieur de Recherche, PATHOGENES, PEA²t, Service qualitébenoit.valot@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, bureau R217 (HdC)
Nos axes de recherche
Ces axes organisent la recherche “du terrain et de la clinique à la biologie moléculaire” sur des espèces microbiennes appartenant à tous les grands groupes d’AP (bactéries, parasites, levures, champignons, acariens et virus).
Diffusion des agents pathogènes humains
La diffusion des agents pathogènes (AP) est étudiée à partir de collections de micro-organismes isolés de prélèvements d’origine humaine, mais également environnementale (professionnel, domestique, hospitalier) et animale (élevage et faune sauvage).
Résistance aux agents antimicrobiens (RAM)
La lutte contre la résistance aux agents antimicrobiens est un défi majeur de santé publique et s’appuie sur l’étude de la prévalence et sur l’identification des déterminants géniques de résistance aux agents antibactériens et antifongiques.
Interaction hôte-pathogène
L’étude de la relation hôte-pathogène s’appuie sur une approche immunologique qui permet de quantifier l’exposition aux AP dans divers environnements par la mesure des anticorps produits (IgE pour les réponses allergiques immédiates et IgG pour les réponses infectieuses et immuno-allergiques).
Nos projets en cours
RAMA
Les cancers solides sont traités avec médicaments qui attaquent l'ADN des cellules cancéreuses et des bactéries du microbiote digestif. Avec le projet RAMA, nous souhaitons tester si les médicaments anticancéreux favorisent le développement de bactéries résistantes aux antibiotiques en utilisant différents modèles : chez des patients traités par des cytotoxiques, dans un modèle in vitro de microbiote digestif et un modèle murin de microbiote humanisé.
Nos actualités
Programme Careli : campagnol, renard, lièvre… et tique également
Le nouveau reportage du programme CARELI avec Patrick Giraudoux (Chrono-environnement) et Geoffroy Couval (FREDON, Chrono-environnement)
Chimistes au service de la santé, rencontre avec Stéphane ROUX et Rana BAZZI
Stéphane ROUX et Rana BAZZI ont rejoint le laboratoire en janvier 2024. Rencontre croisée avec un couple d'enseignants-chercheurs qui jonglent avec les nanoparticules.Labo - quelle est votre discipline de recherche ?Stéphane Roux (SR) - La chimie et plus...
Jean-Luc Prétet, PU-PH, expert en carcinogenèse virale, a rejoint Chrono-environnement
Jean-Luc Prétet, quelle est votre discipline de recherche ? Votre métier en deux mots ?Biologie - Santé, plus particulièrement je m'intéresse à la carcinogenèse virale : des mécanismes moléculaires à la prévention des cancers associés aux papillomavirus...
Qui sommes-nous?
Coordinateurs⋅trices
- Frédéric Grenouillet, Professeur des universités - praticien hospitalier (PU-PH) – UMLP, CHU Besançon, PATHOGENESfrederic.grenouillet@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, bureau CHU Besançon
- Benoit Valot, Ingénieur de Recherche, PATHOGENES, PEA²t, Service qualitébenoit.valot@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, bureau R217 (HdC)
Membres
Coralie Barrera, Ingénieure de Recherche, PATHOGENES, PEA²tcoralie.barrera@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 63 08 22 34, bureau R28 (HdC)
Rana Bazzi, Maîtresse de Conférences – UMLP, PATHOGENES, POLLUTIONrana.bazzi@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 81 66 62 94, bureau 308K (La Bouloie)- Anne-Pauline Bellanger, Maître de conférences des universités - praticien hospitalier (MCU-PH) – UMLP, CHU Besançon, PATHOGENESanne-pauline.bellanger@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, bureau CHU Besançon
Xavier Bertrand, Professeur des universités - praticien hospitalier (PU-PH) – UMLP, CHU Besançon, PATHOGENESxbertrand@-Code to remove to avoid SPAM-chu-besancon.fr, xbertran@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 70 63 21 36, bureau R+3 A8.1 (CHU)
Adrien Biguenet, Membre associé – CHU Besançon, PATHOGENESadrien.biguenet@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, adrien.biguenet@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 70 63 21 46, bureau R216 (HdC)- Louis Bohard, Doctorant, PATHOGENESlouis.bohard@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 81 21 91 83, bureau CHU Besançon
Kévin Bouiller, Professeur des universités - praticien hospitalier (PU-PH) – UMLP, CHU Besançon, PATHOGENESkevin.bouiller@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 81 21 91 87, bureau CHU Besançon
Thibault Bourdin, Postdoctorant, PATHOGENEStbourdin@-Code to remove to avoid SPAM-chu-besancon.fr, +33 (0)3 63 08 22 41, bureau R227 (HdC)
Céline Bouvier-Slekovec, Maître de conférences des universités - praticien hospitalier (MCU-PH) – UMLP, CHU Besançon, PATHOGENESceline.bouvier@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 81 66 55 52 (fac) / +33 (0)3 70 63 25 97 (CHU), bureau S232 (UFR Santé), et bureau Service d’hygiène hospitalière (CHU Besançon)
Bruno Cardey, Maître de Conférences – UMLP, PATHOGENES, POLLUTIONbruno.cardey@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 81 66 65 05, bureau 304K (La Bouloie)
Audrey Cardot Laboissiere, Technicienne – CNRS, PATHOGENES, PEA²t, Service qualité, SERVICESaudrey.laboissiere@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, bureau R217 (HdC), et bureau -211M (La Bouloie)
Laura Camila Carrera Paéz, Postdoctorante, PATHOGENESlcarrerapaez@-Code to remove to avoid SPAM-chu-besancon.fr, +33 (0)3 63 08 22 41, bureau R227 (HdC)- Catherine Chirouze, Professeur des universités - praticien hospitalier (PU-PH) – UMLP, CHU Besançon, PATHOGENEScatherine.chirouze@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, bureau CHU Besançon
- Pascal Cholley, Membre associé – Ingénieur d’étude et de recherche clinique CHU Besançon, PATHOGENESpcholley@-Code to remove to avoid SPAM-chu-besancon.fr
- Florent Demonmerot, Membre associé – Ingénieur d’étude et de recherche clinique CHU Besançon, PATHOGENESfdemonmerot@-Code to remove to avoid SPAM-chu-besancon.fr
Nolwen Di Domizio, Doctorante, PATHOGENESnolwen.di_domizio@-Code to remove to avoid SPAM-edu.univ-fcomte.fr, +33 (0)3 63 08 22 15 , bureau R134 (HdC)- Nathalie Floret, Maîtresse de conférences des universités - praticien hospitalier (MCU-PH) – UMLP, CHU Besançon, PATHOGENESNFloret@-Code to remove to avoid SPAM-chu-besancon.fr
Adeline Gagnon, Doctorante, PATHOGENESadeline.gagnon@-Code to remove to avoid SPAM-umlp.fr, +33 (0)3 63 08 22 75, bureau R245 (HdC)
Susie Gaillot, Ingénieure de Recherche – CHU Besançon, PATHOGENES+33 (0)3 70 63 21 68, bureau R214 (HdC)
Patrick Giraudoux, Professeur Émérite, DYNABIO, PATHOGENESpatrick.giraudoux@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, bureau -110M (La Bouloie)
Mathieu Guillaume, Technicien – CHU Besançon, PATHOGENESm8guillaume@-Code to remove to avoid SPAM-chu-besancon.fr, +33 (0)3 63 08 22 33, bureau R37 (HdC)
Audrey Guitton, Technicienne, PATHOGENES, PEA²t, Service qualitéaudrey.guitton@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 63 08 22 36, bureau R29 (HdC)
Laura Henckel, Postdoctorante, DYNABIO, PATHOGENES, POLLUTION, SOPASTlaura.henckel@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 81 66 65 63, bureau -114M (La Bouloie)
Didier Hocquet, Professeur – UMLP, PATHOGENESdhocquet@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 70 63 21 34, bureau R212 (HdC)
Katy Jeannot, Professeur des universités - praticien hospitalier (PU-PH) – UMLP, CHU Besançon, PATHOGENESkaty.jeannot@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, bureau R213 (HdC)
Clémence Kavira, Doctorante, PATHOGENESclemence.kavira@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, bureau -109M (La Bouloie)
Jenny Knapp, Ingénieure de Recherche – CHU Besançon, PATHOGENESjknapp@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 70 63 21 06, bureau R+3.B1.2 (CHU) / R251 (HdC)
- Quentin Lepiller, Professeur des universités - praticien hospitalier (PU-PH) – UMLP, CHU Besançon, PATHOGENESquentin.lepiller@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, bureau CHU Besançon
Catherine Llanes, Professeure – UMLP, PATHOGENES, Service communicationchrono-env.direction@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 63 08 22 76, bureau R222 (HdC)- Libor Makovicka, Professeur Émérite, PATHOGENESlibor.makovicka@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 81 99 46 74, bureau Montbéliard
- Tania Marx, Maîtresse de conférences des universités - praticien hospitalier (MCU-PH) – UMLP, CHU Besançon, PATHOGENEStania.marx@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr
Mathilde Massard, Maîtresse de Conférences – UMLP, PATHOGENESmathilde.massard@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, bureau R227 (HdC)- Frédéric Mauny, Professeur des universités - praticien hospitalier (PU-PH) – UMLP, CHU Besançon, PATHOGENESfrederic.mauny@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr
Laurence Millon, Professeur des universités - praticien hospitalier (PU-PH) – UMLP, CHU Besançon, PATHOGENESlmillon@-Code to remove to avoid SPAM-chu-besancon.fr, +33 (0)3 70 63 23 53, bureau CHU Besançon
Antoine Perasso, Professeur – UMLP, DYNABIO, GEODE, PATHOGENES, POLLUTIONantoine.perasso@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, bureau -110L (La Bouloie)
Anaïs Potron, Maître de conférences des universités - praticien hospitalier (MCU-PH) – UMLP, CHU Besançon, PATHOGENESanais.potron@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 70 63 21 68, bureau R214 (HdC)
Jean-Luc Prétet, Professeur des universités - praticien hospitalier (PU-PH) – UMLP, CHU Besançon, PATHOGENESjean_luc.pretet@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 70 63 20 51, bureau HdC
Francis Raoul, Professeur – UMLP, DYNABIO, PATHOGENES, POLLUTIONfrancis.raoul@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 81 66 57 36, bureau -114L (La Bouloie)- Dominique Rieffel, Technicien, PATHOGENES, PEA²t, POLLUTIONdominique.rieffel@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 81 66 63 52, bureau -104L (La Bouloie)
Steffi Rocchi, Chercheuse associée, PATHOGENES, POLLUTIONsteffi.rocchi@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 63 08 22 39, bureau R210 (HdC)
Julie Rousselot, Doctorante, CHU Besançon, PATHOGENESjulie.rousselot@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 63 08 22 33, bureau R27 (HdC)
Stéphane Roux, Professeur – UMLP, PATHOGENES, POLLUTIONstephane.roux@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 81 66 62 99, bureau 308K (La Bouloie)
Adeline Rouzet-San, Ingénieure de Recherche – CHU Besançon (Parasitologie-Mycologie), PATHOGENES, PEA²tadeline.rouzet@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 63 08 22 34, bureau R28 (HdC)
Lison Schmidlin, Adjointe Technique de Recherche et de Formation (ITRF) – UFR Santé, PATHOGENES, PEA²tlison.schmidlin@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 63 08 22 36, bureau R29 (HdC)
Hugo Sentenac, Maître de Conférences – IUT Besançon-Vesoul, DYNABIO, PATHOGENES, POLLUTIONhugo.sentenac@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, bureau -105M (La Bouloie)- Momar Thiaw Sylla, Doctorant, PATHOGENESmomar.thiaw_sylla@-Code to remove to avoid SPAM-edu.univ-fcomte.fr, bureau R212 (HdC)
Freddy Torrealba Anzola, Ingénieur de Recherche – UMLP, PATHOGENES, PEA²tfreddy.torrealba_anzola@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 81 66 65 17, bureau 309K (La Bouloie)
Laboratoire Chrono-environnement
UMR 6249
Université Marie et Louis Pasteur
16, Route de Gray
25030 Besançon cedex
Téléphone : +33 (0)3 81 66 62 55
Télécopie : +33 (0)3 81 66 65 68
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