Antibiorésistance
Plateforme technologique d’étude des Environnements Anciens et Actuels (PEA²t)
Analyse de l’antibiorésistance et des structures de populations des pathogènes bactériens
Type d’échantillons : Bactérie
Culture et caractérisation phénotypique (résistance, virulence) de bactéries pathogènes.
Construction de mutants pour l’inactivation ou la sur-expression de gènes étudiés
Analyse quantitative d’expression génique
Reconstruction du génome à partir de données de séquençage haut-débit
Génotypage et analyse des liens épidémiologiques
Construction de mutants pour l’inactivation ou la sur-expression de gènes étudiés
Analyse quantitative d’expression génique
Reconstruction du génome à partir de données de séquençage haut-débit
Génotypage et analyse des liens épidémiologiques
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Domaines d’expertise et compétences
Isolation et caractérisation de l’ADN environnemental
Mise en œuvre de techniques de biologie moléculaire telles que la PCR quantitative, ou la métagénomique pour l’analyse de l’ADN issu d’échantillons environnementaux.
Personnels impliqués
Lister les personnels
Nadia Crini, Ingénieur de Recherche, PEA²t, POLLUTIONnadia.crini@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 81 66 57 86, bureau -203M (La Bouloie)
Benoit valot, Ingénieur de Recherche, PEA²t, Service qualitébenoit.valot@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, bureau R217 (HdC)
Exemples d’application
- Détermination du mécanisme de résistance de souches isolées chez des patients
- Reconstruction de l’évolution phylogénétique et phénotypique de clone épidémique
Principaux équipements sollicités
PCR quantitative
Serveur de calcul
