ENVI-FUNGI-R
Projet ENVI-FUNGI-R
Environmental tracking of opportunistic fungi and antifungal resistance with citizen science study
Le projet ENVI-FONGI-R s'intéresse à la répartition de différents pathogènes fongiques (moisissures pouvant provoquer des infections chez les plus fragiles) en Bourgogne Franche-Comté. À l'aide d'une étude en sciences participatives, SporeWatch BFC, où des volontaires feront quatre types de prélèvements à leur domicile (air, poussières, eau, terre) le projet vise à caractériser ces pathogènes, les quantifier et mesurer les niveaux de base de la résistance aux traitements antifongiques.
L’objectif de ce projet est de caractériser les réservoirs environnementaux et la distribution spatiale des Aspergillus résistants aux azoles (AR), Mucorales et Fusarium — principaux champignons filamenteux responsables d’infections fongiques invasives (IFI) — dans les environnements intérieurs et extérieurs de la région Bourgogne-Franche-Comté. Ces champignons thermotolérants, de plus en plus impliqués dans des pathologies graves, présentent des niveaux préoccupants de résistance aux antifongiques, liés notamment à l’usage de fongicides agricoles et aux changements globaux. Comprendre leur écologie, les voies d’exposition humaine et les liens entre leur présence, leur résistance et les cas d’IFI est essentiel pour améliorer la prévention, notamment chez les patients immunodéprimés.
Pour atteindre ces objectifs, une campagne d’échantillonnage participative régionale (SporeWatch BFC) sera menée : quatre méthodes simples et peu coûteuses permettront de collecter les spores fongiques : air extérieur (pièges deltatraps), air intérieur (capteurs électrostatiques de poussières), sols et eau du robinet.
Les échantillons seront analysés par culture et biologie moléculaire pour détecter, identifier et quantifier les espèces d’Aspergillus résistants aux azoles, Mucorales et Fusarium. Des tests de croissance in vitro évalueront l’effet de la température, du pH et des fongicides sur le développement fongique. Les données environnementales (occupation des sols, traitements fongicides, climat) seront intégrées à l’aide de modèles géospatiaux et multivariés à effets mixtes afin d’identifier les facteurs favorisant l’émergence et la résistance fongiques. Les comparaisons entre compartiments (air, sol, eau) et entre environnements intérieurs et extérieurs permettront d’étudier les transferts potentiels et les corrélations avec les cas d’IFI recensés.
Notice d’installation
En bref
Durée du projet : du 01/09/2026 au 31/08/2029
Financement : HARMI AAP2, 149 k€
Coordination du projet :
Laurence Millon, Professeur des universités - praticien hospitalier (PU-PH) – UMLP, CHU Besançon, PATHOGENESlmillon@-Code to remove to avoid SPAM-chu-besancon.fr, +33 (0)3 70 63 23 53, bureau CHU Besançon
Steffi Rocchi, Postdoctorante, PATHOGENES, POLLUTIONsteffi.rocchi@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 63 08 22 39, bureau R210 (HdC)
Autres membres du laboratoire impliqués
Personnels recrutés :
- Steffi Rocchi (Post-doctorat)
Partenaires et laboratoires associés :
- UMR PAM / CHU Dijon (Frédéric Dalle et Marc Sautour)
- Support scientifique : Eveline Snelders, Laboratory of Genetics, Wageningen University
Chaine opératoire PEA²t
Nos partenaires
