Parasitologie

Plateforme technologique d’étude des Environnements Anciens et Actuels (PEA²t)

Suivi de populations sauvages et parasitologiques

Type d’échantillons : Fèces Organes

À partir d’ADN ou ARN extrait, différentes analyses sont réalisées pour la caractérisation en écologie moléculaire d’échantillons de faunes sauvages.

  • Caractérisation en écologie moléculaire d’échantillon de faune sauvage :
    • Sexage
    • Diagnostiques moléculaires (recherche des parasites)
    • Génotypage des individus et/ou des parasites
  • Techniques :
    • Extraction ADN/ARN
    • PCR et PCR quantitative
    • Séparation en électrophorèse (gel ou capillaire)
Echinococcus ©

Domaines d’expertise

Monitoring in situ et expérimentation en conditions contrôlées

Instrumentation et biosurveillance in situ pour le suivi long terme des milieux naturels dans le cadre des SNO et zones ateliers ; dispositifs de culture et d’élevage en enceinte climatique.

Isolation et caractérisation de l’ADN environnemental

Mise en œuvre de techniques de biologie moléculaire telles que la PCR quantitative, ou la métagénomique pour l’analyse de l’ADN issu d’échantillons environnementaux.

Exemples d’application

  • Suivi des populations du parasite responsable de l’échinococcose chez le renard.
  • Caractérisation génotypique des populations de lynx

Principaux équipements sollicités

Appareil PCR

PCR quantitative

Analyseur de fragment

Personnels impliqués

Membres du laboratoire :

  • Michael Coeurdassier, Maître de Conférences – UMLP, POLLUTION
    michael.coeurdassier@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 81 66 57 41, bureau -110L (La Bouloie)
  • Anne-Claude Gabiot, Assistante Ingénieure – UMPL, PEA²t
    anne-claude.gabiot@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 81 66 62 63, bureau -211M (La Bouloie) recherche ou 013L (La Bouloie) enseignement
  • Jenny Knapp, Ingénieure de Recherche – CHU Besançon, PATHOGENES
    jknapp@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 70 63 21 06, bureau R+3.B1.2 (CHU) / R251 (HdC)
  • Laurence Millon, Professeur des universités - praticien hospitalier (PU-PH) – UMLP, CHU Besançon, PATHOGENES
    lmillon@-Code to remove to avoid SPAM-chu-besancon.fr, +33 (0)3 70 63 23 53, bureau CHU Besançon
  • Francis Raoul, Professeur – UMLP, DYNABIO, PATHOGENES, POLLUTION
    francis.raoul@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 81 66 57 36, bureau -114L (La Bouloie)
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