Antimicrobiens
Plateforme technologique dâĂ©tude des Environnements Anciens et Actuels (PEAÂČt)
Analyse de la résistance aux antimicrobiens et des structures de populations des pathogÚnes bactériens et fongiques
Type d’Ă©chantillons : BactĂ©ries Champignons
Des isolats de microorganismes bactériens et fongiques issus de prélÚvements cliniques ou environnementaux sont caractérisés au niveau phénotypique et génotypique.
- Culture et caractérisation phénotypique (résistance, virulence) de bactéries ou champignons pathogÚnes.
- Construction de mutants pour lâinactivation ou la sur-expression de gĂšnes Ă©tudiĂ©s
- Analyse quantitative dâexpression gĂ©nique
- Reconstruction du génome à partir de données de séquençage haut-débit
- Génotypage et analyse des liens épidémiologiques
Légende photo ©
Domaines d’expertise
Isolation et caractĂ©risation de lâADN environnemental
Mise en Ćuvre de techniques de biologie molĂ©culaire telles que la PCR quantitative, ou la mĂ©tagĂ©nomique pour l’analyse de l’ADN issu d’Ă©chantillons environnementaux.
Exemples d’application
- Détermination du mécanisme de résistance de souches isolées chez des patients
- Reconstruction de lâĂ©volution phylogĂ©nĂ©tique et phĂ©notypique de clone Ă©pidĂ©mique
Pourquoi huiles essentielles et antibiotiques ne font pas toujours bon ménage
InhalĂ©es, ingĂ©rĂ©es, appliquĂ©es sur la peau⊠Les huiles essentielles agrĂ©mentent le quotidien de nombreuses personnes. Pourtant, ces substances ne sont pas anodines. Des travaux rĂ©cents dĂ©montrent notamment que certaines dâentre elles peuvent interfĂ©rer avec lâusage des antibiotiques.
Comment des bulbes de fleurs traités rendent résistantes des moisissures dangereuses pour la santé
Quel est le rapport entre les bulbes de tulipe et lâaspergillose, une grave maladie due Ă un champignon microscopique, la moisissure Aspergillus fumigatus ?
Principaux équipements sollicités
Centre de calcul
MesoBFC
SĂ©quenceur long-read
Personnels impliqués
Membres du laboratoire :
Audrey Cardot Laboissiere, Technicienne â CNRS, PATHOGENES, PEAÂČt, Service qualitĂ©, SERVICESaudrey.laboissiere@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, bureau R217 (HdC), et bureau -211M (La Bouloie)
Didier Hocquet, Professeur â UMLP, PATHOGENESdhocquet@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 70 63 21 34, bureau R212 (HdC)
Katy Jeannot, Professeur des universitĂ©s - praticien hospitalier (PU-PH) â UMLP, CHU Besançon, PATHOGENESkaty.jeannot@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, bureau R213 (HdC)
Catherine Llanes, Professeure â UMLP, PATHOGENES, Service communicationchrono-env.direction@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, +33 (0)3 63 08 22 76, bureau R222 (HdC)
Benoit Valot, IngĂ©nieur de Recherche, PEAÂČt, Service qualitĂ©benoit.valot@-Code to remove to avoid SPAM-univ-fcomte.fr, bureau R217 (HdC)