Projets

Chrono-environnement

Les projets de recherche

DYNABIOGT E.A.U.POLLUTIONEutrophisationMunitionsPollutionProjet en cours Santé Vosges

MUSLI

Face aux défis actuels liés à la pollution et au changement climatique, le projet MUSLI développe une approche pluridisciplinaire visant à mieux comprendre les mécanismes de dégradation des lacs. Original par le croisement de l’écologie, de la chimie et de l’histoire environnementale, ce projet de recherche étudie à la fois les impacts des anciennes munitions immergées et ceux de l’eutrophisation sur les écosystèmes lacustres. Grâce à des méthodes innovantes et à une vision intégrée des enjeux environnementaux, le projet contribuera à protéger durablement les milieux aquatiques.

SOPASTÂge du BronzeAnalyse spatialeDépôts métalliquesJura occidentalProjet en coursSites fortifiés

PCR Dépôts de la région salinoise

Ce programme étudie les dépôts métalliques de l’âge du Bronze autour des sites fortifiés des environs de Salins-les-Bains, pour documenter leurs modalités d’enfouissement et leur rôle dans l’organisation du territoire. Associant prospections ciblées, analyses spatiales et technologies 3D, il offre une compréhension inédite des logiques d’implantation et des pratiques rituelles dans un paysage de moyenne montagne.

DYNABIOObservatoiresConnectivitésDéperissement ForêtProjet en coursScolytes

FOR’EST ADN

Ce projet cherche à comprendre le rôle du paysage dans la diffusion des scolytes dans le massif jurassien. Il regroupe des compétences et des champs thématiques variés en écologie, en géographie, en gestion et analyse de données environnementales complexes. Le projet s’inscrit dans l’Observatoire des forêts comtoises, s’appuyant sur l’expertise des chercheurs et des partenaires territoriaux en vue d’apporter des réponses concrètes aux gestionnaires des forêts face au dépérissement actuel.

DYNABIOObservatoires SOPASTADN ancien ForêtHolocène PIPAFProjet en coursScolytes

PIPAF

L’étude des dynamiques forestières passées via des approches rétrospectives de paléoécologie ou d’écologie historique offre un recul historique nécessaire pour considérer la vulnérabilité et la résilience des forêts, car elles documentent l’état des forêts avant et après une perturbation.
Dans le cadre du projet PIPAF, il sera procédé à la recherche de pullulations du Bostryche typographe (Ips typographus) à travers l’examen de documents d’archives ainsi qu’une approche paléoécologique, incluant l’analyse de macro-restes et d’ADN ancien.

PATHOGENESBactériophageProjet en coursPseudomonas aeruginosaRésistance ST235Système APS

PARADE

Les phages sont des virus qui tuent spécifiquement les bactéries. Ils jouent un rôle crucial dans le contrôle des populations bactériennes dans les écosystèmes. Par un phénomène de coévolution, les bactéries ont développé une grande diversité de défenses anti-phages. Nous émettons l’hypothèse que le succès de certains clones épidémiques qui sont répandus à l’échelle mondiale doivent leur succès, au moins en partie, à leur plus grande résistance aux phages.

DYNABIOObservatoiresClassification ForêtIntelligence artificielleProjet en coursRéseau de neuronesScolytes

ODEON

Les sécheresses et vagues de chaleur fragilisent les forêts françaises, surtout en Bourgogne-Franche-Comté, où les scolytes ravagent épicéas et sapins. Pour mieux gérer ces risques liés au climat, il faut identifier rapidement ces insectes. Le projet ODEON développe des outils d’analyse innovants basés sur l’intelligence artificielle afin d’améliorer le suivi de la biodiversité et la gestion forestière.

PATHOGENESAntibiotiquesAnticancéreuxMicrobiote digestifProjet en coursRéponse SOSRésistance

RAMA

Les cancers solides sont traités avec médicaments qui attaquent l’ADN des cellules cancéreuses et des bactéries du microbiote digestif. Avec le projet RAMA, nous souhaitons tester si les médicaments anticancéreux favorisent le développement de bactéries résistantes aux antibiotiques en utilisant différents modèles : chez des patients traités par des cytotoxiques, dans un modèle in vitro de microbiote digestif et un modèle murin de microbiote humanisé.

PATHOGENESBactéries multirésistantesMicrobiote intestinal humainModèle in vitro / ex vivo du microbiote intestinalProjet en coursRésistance aux antibiotiquesRéutilisation des eaux usées (Reuse)

MEHTA

Avec le changement climatique, une gestion raisonnée des ressources en eau devient cruciale pour l’irrigation. L’usage des eaux usées traitées s’impose en agriculture, mais les effets de l’ingestion de légumes irrigués par ces eaux sur le microbiote intestinal et la résistance aux antibiotiques restent inconnus. Pour y remédier, l’ANR/INSERM finance le projet MEHTA dans le cadre de France 2030, un programme de recherche prioritaire sur la résistance aux antibiotiques.

POLLUTIONProjet en cours
ECOPOLIS

ECOPOLIS

Le projet ECOPOLIS a pour objectif général la restauration d’une friche industrielle en milieu urbain. Il implique l’ensemble de la communauté et il est basé sur l’implantation d’un laboratoire vivant (living lab) à vocation de recherche et pédagogique.

POLLUTIONProjet en cours
EDAPHOS

EDAPHOS

Des méthodes avancées de cartographie, d’évaluation des risques et de dépollution basée sur la nature sont combinées pour accélérer la restauration des sols contaminés et s’assurer qu’elles débouchent sur des offres commerciales.

PATHOGENESMicrobiomePerception du goûtProjet en cours
FLAMME

FLAMME

Le microbiote buccal est composé de 700 espèces de bactéries qui transforment les substances aromatiques. La composition de microbiote étant spécifique à son hôte, les mécanismes derrière le métabolisme microbien des substances aromatiques restent peu connus. FLAMME est un projet qui vise à comprendre le rôle du microbiote buccal dans la perception du goût des aliments en comparant le microbiote de participants ayant différents profils de perception du goût.

DYNABIOObservatoiresConnectivitésDéperissement ForêtProjet en coursScolytes
FOR’EST ADN

FOR’EST ADN

Ce projet cherche à comprendre le rôle du paysage dans la diffusion des scolytes dans le massif jurassien. Il regroupe des compétences et des champs thématiques variés en écologie, en géographie, en gestion et analyse de données environnementales complexes. Le projet s’inscrit dans l’Observatoire des forêts comtoises, s’appuyant sur l’expertise des chercheurs et des partenaires territoriaux en vue d’apporter des réponses concrètes aux gestionnaires des forêts face au dépérissement actuel.

PATHOGENESPOLLUTIONAntibiorésistanceAntimicrobiensAspergillus fumigatusFongicidesProjet en coursRésistance aux antifongiquesStandardisation
GAP-AFR (JPI-AMR)

GAP-AFR (JPI-AMR)

Les médicaments antifongiques azolés utilisés pour traiter les infections à Aspergillus fumigatus (pathogène fongique défini comme prioritaire par l’OMS) sont de moins en moins efficaces du fait de l’utilisation de molécules similaires pour la protection des cultures et des matériaux. Le projet vise à cartographier à l’échelle mondiale le pourcentage d’Aspergillus fumigatus résistants aux azolés, dont la croissance peut persister malgré le traitement antifongique.

PATHOGENESBactéries multirésistantesMicrobiote intestinal humainModèle in vitro / ex vivo du microbiote intestinalProjet en coursRésistance aux antibiotiquesRéutilisation des eaux usées (Reuse)
MEHTA

MEHTA

Avec le changement climatique, une gestion raisonnée des ressources en eau devient cruciale pour l’irrigation. L’usage des eaux usées traitées s’impose en agriculture, mais les effets de l’ingestion de légumes irrigués par ces eaux sur le microbiote intestinal et la résistance aux antibiotiques restent inconnus. Pour y remédier, l’ANR/INSERM finance le projet MEHTA dans le cadre de France 2030, un programme de recherche prioritaire sur la résistance aux antibiotiques.